IUPAC 名称转 SMILES 转换器
简而言之:把系统名称转换为 SMILES,或按名称/CID 从 PubChem 导入化合物。免费,在网页浏览器中运行,无需下载。
把 IUPAC 名称或 PubChem 化合物名称转换为 SMILES,便于把文献中的名称变成结构字符串。名称需为英文。
SMILES 将显示在这里。
输入和输出格式
| 输入:IUPAC 名称 | 输出:SMILES | |
|---|---|---|
| 全称 | IUPAC 名称 | SMILES (Simplified Molecular Input Line Entry System) |
| 包含内容 | 按 IUPAC 命名规则得到的系统化学名称。 | 以一行文本表示原子、键、环、电荷和立体信息,不含坐标。 |
| 文件或形式 | 文本 | .smi 或纯文本 |
文件格式说明
IUPAC 名称是系统描述结构的正式化学名称,适用于论文和教学,但长名称很难粘贴到软件流程中使用。
SMILES 是绘图工具、数据库、化学信息学脚本和转换器使用的简洁结构字符串。把 IUPAC 名称转换为 SMILES,可以把文献名称变成机器可读的结构。
名称解析最适合明确、公认的名称。盐、混合物、立体化学、俗名和拼写差异可能导致无结果或返回不同的记录。
名称转 SMILES 的技巧
系统的 IUPAC 名称能精确表示结构,但名称很长,容易输错。把名称转换为 SMILES,就得到一个简洁、机器可读的结构,可以粘贴到绘图工具或电子表格中。
示例
- propan-2-ol →
CC(C)O - 2-acetyloxybenzoic acid(阿司匹林)→
CC(=O)OC1=CC=CC=C1C(=O)O - (2S)-2-aminopropanoic acid(L-丙氨酸)→
C[C@@H](C(=O)O)N
获得良好结果
- 准确复制名称,包括位次、逗号、连字符和括号:1,2-dichloroethane 与 1,1-dichloroethane 不同。
- 如需特定异构体,请加上 (R)、(S)、(E) 或 (Z) 等立体描述符;否则立体化学可能未定义。
- caffeine 这样的俗名通常也能使用,但非常新或罕见的商品名可能不行。
- 注意从 PDF 中复制的排版字符,例如特殊破折号或撇号,请替换为普通连字符和撇号。
要反向转换?请使用 SMILES 转 IUPAC 名称。
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