XYZ 转 SMILES 转换器
简而言之:粘贴或上传 XYZ 坐标文件,推断化学键,将结构载入可编辑的 2D 画布,并复制尽力生成的 SMILES。免费使用,在网页浏览器中运行,无需下载。
粘贴或上传 XYZ 坐标文件,推断可能的化学键,将结果载入可编辑的 2D 画布,并复制尽力生成的 SMILES 字符串。
快速解答:XYZ 文件不存储键级,因此本工具先构建一个推断出的 MOL 文件,由 MolDraw 编辑器整理 2D 布局,再从可编辑的结构中读取 SMILES。
输入 XYZ 坐标
就绪。粘贴 XYZ 坐标后进行转换。
输入与输出格式
| 输入:XYZ 坐标文件 | 输出:SMILES | |
|---|---|---|
| 全称 | XYZ 坐标文件 | SMILES(简化分子线性输入规范) |
| 包含的信息 | 只有元素符号和 x、y、z 坐标。不存储化学键,需要推断得出。 | 以一行文本表示原子、化学键、环、电荷和立体化学,不含坐标。 |
| 文件或形式 | .xyz | .smi 或纯文本 |
XYZ 转 SMILES 说明
XYZ 文件通常只存储原子符号和 3D 坐标,一般不包含键级、形式电荷、芳香性或立体化学。
请把它当作尽力而为的转换器。在数据库、建模工具、论文或作业中使用 SMILES 之前,请先在 2D 编辑器中检查推断出的化学键。
- 生成 SMILES 之前会隐藏与碳相连的氢原子,以便编辑器使用常规的隐式氢。
- 键级一律推断为单键;需要时请手动修正双键、芳香环、电荷和立体化学。
- 如果想先得到可视化的可编辑结构,请使用 XYZ / Gaussian 转 2D 结构转换器。
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