SMILES 转 SDF 转换器

简而言之：将 SMILES 字符串转换为 SDF 格式，用于虚拟筛选和数据集流程。免费使用，在网页浏览器中运行，无需下载。

将 SMILES 转换为 SDF，用于数据集和虚拟筛选流程。

文件格式说明

SMILES 是表示分子连接方式的紧凑字符串，便于检索和交换，但通常不包含丰富的元数据。

SDF 是一种结构数据文件格式，可以存储一条或多条分子记录，通常包含 MOL 式的原子/键块以及可选的性质字段。SDF 常见于筛选库、化合物数据集和化学信息学流程中。

需要一个能同时携带结构记录和化合物性质的文件时，请使用 SDF。批量使用前请检查立体化学和生成的坐标。

为什么用 SDF

SDF（结构数据文件）存储一个或多个结构，每个结构是一个 MOL 连接表，后面跟着可选的命名数据字段和 $$$$ 分隔符。它是在化学信息学工具、化合物登记系统和数据库之间传递化合物集的标准方式，因为编号、名称或测试结果等性质可以随每个结构一起传递。

使用方法

1. 粘贴 SMILES，例如对乙酰氨基酚 CC(=O)NC1=CC=C(C=C1)O。
2. 转换并下载 .sdf 文件。
3. 在化学软件中打开它，或把多个转换好的文件合并成一个化合物库。

记录布局示例

• 标题行，然后是给出原子数和键数的计数行。
• 原子块（坐标和元素）以及键块。
• M END，然后是 > <NAME> 等数据字段，后面跟着数值。
• 用 $$$$ 结束该记录。

常见问题

SDF 和 MOL 有什么区别？MOL 文件只包含一个结构；SDF 可以包含多个结构及其数据。可以再转回标识符吗？可以，使用 SDF 转 InChIKey 或 SDF 转 InChI。