CID 转 SMILES 转换器

简而言之:将化合物 ID 解析为规范 SMILES 字符串,便于化学工作流程使用。免费使用,在网页浏览器中运行,无需下载。

将 PubChem CID 转换为规范 SMILES 标识符。

SMILES 输出将显示在这里。

输入与输出格式

输入:PubChem CID输出:SMILES
全称PubChem CIDSMILES(简化分子线性输入规范)
包含的信息PubChem 数据库中某条记录的化合物 ID,通过查询获得结构。以一行文本表示原子、化学键、环、电荷和立体化学,不含坐标。
文件或形式整数,例如 2244.smi 或纯文本

文件格式说明

PubChem CID 是 PubChem 使用的数字化合物标识符。它指向一条数据库记录,而不是直接编码分子结构。

SMILES 是一种紧凑的分子连接关系线性表示法。当数据库只给出 PubChem ID,而绘图或化学信息学工具需要结构字符串时,把 CID 转换为 SMILES 就很有用。

CID 查询依赖 PubChem 记录。不同的化合物记录、盐、同位素或立体化学形式可能有不同的 CID 和 SMILES 字符串。

关于 PubChem CID

PubChem 化合物 ID(CID)是 PubChem 为其数据库中每个独特化学结构分配的数字标识符。例如,阿司匹林是 CID 2244,咖啡因是 CID 2519。论文、供应商目录和数据集常引用 CID,但单凭一个数字无法知道结构。将其转换为 SMILES 即可得到可编辑的结构字符串。

使用方法

  1. 输入一个 CID(仅数字,不带“CID”前缀)。
  2. 运行转换,从 PubChem 获取规范 SMILES。
  3. 将 SMILES 复制到 MolDraw、电子表格或其他转换器中。

常见问题

CID 和 CAS 号一样吗?不一样。CAS 登记号由美国化学文摘社(CAS)分配,格式带连字符,如 50-78-2;CID 是 PubChem 自己的顺序编号。为什么盐会得到带点的 SMILES?盐和混合物包含多个独立组分,SMILES 用点号分隔它们,例如 [Na+].[Cl-]。

下一步:用 SMILES 转结构绘制结构,或用 SMILES 转 InChIKey 获取标识符。

最后更新: