Convertitore da XYZ / Gaussian a struttura 2D

In breve: Incolla o carica XYZ, file Gaussian .gjf, .com o testo di coordinate e genera una struttura molecolare 2D modificabile con legami dedotti. È gratuito, funziona nel browser e non richiede download.

Incolla o carica XYZ, input Gaussian o testo di coordinate cartesiane e genera una struttura 2D modificabile con legami dedotti.

Risposta rapida: questo strumento legge le coordinate degli atomi, deduce i legami probabili dai raggi covalenti, proietta la geometria 3D in 2D, carica il risultato nell'editor integrato ed esporta SVG, PNG o un file MOL dedotto.

Coordinate di input

Pronto. Incolla le coordinate e converti.

Struttura 2D modificabile

Caricamento dell'editor...
Anteprima SVG statica dedotta
L'anteprima della struttura 2D compare qui.

Blocco MOL dedotto

MOL output appears here.

Formati di file spiegati

XYZ memorizza i simboli degli atomi e le coordinate 3D, di solito senza ordini di legame, cariche, aromaticità o stereochimica. È diffuso nella chimica computazionale e nella chimica quantistica.

I file di input Gaussian come .gjf e .com contengono spesso una riga di carica/molteplicità seguita dalle coordinate cartesiane. Questo strumento estrae questi blocchi di coordinate quando possibile.

Poiché i file di coordinate XYZ e Gaussian di solito non memorizzano l'ordine di legame, il risultato è una struttura 2D approssimata al meglio. Usa il canvas 2D integrato per correggere i legami dedotti prima di pubblicazioni, docking o analisi chemioinformatiche successive.

Ultimo aggiornamento: