Konverter SMILES ke InChIKey
Singkatnya: Ubah string SMILES menjadi pengenal InChIKey yang dapat dicari. Gratis, berjalan di peramban web Anda, dan tidak perlu diunduh.
Buat pengenal InChIKey yang ringkas dari string SMILES.
Format masukan dan keluaran
| Masukan: SMILES | Keluaran: InChIKey | |
|---|---|---|
| Nama lengkap | SMILES (Simplified Molecular Input Line Entry System) | InChIKey |
| Isi data | Atom, ikatan, cincin, muatan, dan stereo dalam satu baris teks. Tanpa koordinat. | Hash 27 karakter dari InChI, dibuat untuk pencarian di web dan basis data. Hash ini tidak dapat diubah kembali menjadi struktur tanpa basis data pencarian. |
| File atau bentuk | .smi atau teks biasa | Teks seperti XXXXXXXXXXXXXX-YYYYYYYYYY-Z |
Penjelasan Format File
SMILES adalah notasi teks ringkas untuk struktur molekul. Notasi ini berguna untuk alur kerja masukan, pengeditan, dan konversi.
InChIKey adalah pengenal hash dengan panjang tetap yang diturunkan dari InChI. Pengenal ini dirancang untuk pencocokan basis data dan pencarian web yang cepat, tetapi tidak dapat dibalik dengan sempurna tanpa pencarian basis data.
Gunakan InChIKey jika Anda memerlukan kunci pencarian yang stabil untuk suatu senyawa; gunakan SMILES jika Anda memerlukan string struktur yang dapat diedit.
Mengapa menggunakan InChIKey
InChIKey dirancang untuk pencarian. Menempelkan InChI atau SMILES lengkap ke mesin pencari sering gagal, karena simbol seperti =, /, dan tanda kurung diperlakukan secara khusus. Kunci 27 karakter yang hanya terdiri atas huruf dan tanda hubung dapat dicari dengan bersih dan cocok dengan catatan basis data secara andal.
Contoh
Kafein, CN1C=NC2=C1C(=O)N(C(=O)N2C)C, menghasilkan InChIKey RYYVLZVUVIJVGH-UHFFFAOYSA-N. Mencari kunci itu menampilkan halaman kafein di PubChem, ChEMBL, dan basis data lainnya.
Struktur kunci
- 14 karakter pertama: hash konektivitas.
- 10 karakter berikutnya: hash lapisan stereokimia dan isotop, ditambah penanda versi.
UHFFFAOYSAmuncul untuk struktur tanpa lapisan stereo atau isotop. - Karakter terakhir: protonasi (N = netral).
FAQ
Apakah enantiomer mendapat kunci yang berbeda? Ya, jika stereokimianya ditentukan dalam SMILES. Keduanya memiliki blok pertama yang sama dan berbeda pada blok kedua. Bisakah saya mendapatkan kembali struktur dari kunci? Hanya melalui pencarian basis data, menggunakan InChIKey ke SMILES.
Terakhir diperbarui: