Konverter SMILES ke InChI
Singkatnya: Ubah string SMILES menjadi pengenal InChI standar untuk alur kerja basis data dan publikasi. Gratis, berjalan di peramban web Anda, dan tidak perlu diunduh.
Ubah SMILES menjadi InChI standar untuk pencarian, pengindeksan, dan alur kerja publikasi.
Format masukan dan keluaran
| Masukan: SMILES | Keluaran: InChI | |
|---|---|---|
| Nama lengkap | SMILES (Simplified Molecular Input Line Entry System) | InChI (IUPAC International Chemical Identifier) |
| Isi data | Atom, ikatan, cincin, muatan, dan stereo dalam satu baris teks. Tanpa koordinat. | Pengenal teks berlapis yang dibuat dari struktur. InChI standar sama di setiap program. |
| File atau bentuk | .smi atau teks biasa | Teks yang diawali InChI=1S/ |
Penjelasan Format File
SMILES adalah notasi baris ringkas untuk konektivitas molekul. Notasi ini praktis untuk alat gambar, kotak pencarian, dan skrip.
InChI adalah IUPAC International Chemical Identifier. InChI adalah pengenal berlapis dan terstandar yang dirancang untuk pertukaran, pengindeksan, dan perbandingan basis data kimia.
Gunakan SMILES jika Anda memerlukan string struktur yang dapat diedit. Gunakan InChI jika Anda memerlukan pengenal terstandar yang tidak terlalu bergantung pada gaya kanonikalisasi SMILES tertentu.
Contoh dan cara membaca keluaran
SMILES aspirin CC(=O)OC1=CC=CC=C1C(=O)O dikonversi menjadi:
InChI=1S/C9H8O4/c1-6(10)13-8-5-3-2-4-7(8)9(11)12/h2-5H,1H3,(H,11,12)
1S: versi 1, InChI standar.C9H8O4: lapisan rumus molekul./c…: lapisan konektivitas, menggunakan penomoran atom milik InChI sendiri./h…: letak atom hidrogen; tanda kurung menandai hidrogen bergerak yang dibagi antara dua oksigen asam karboksilat.
Mengapa molekul yang sama selalu menghasilkan InChI yang sama
Beberapa SMILES yang berbeda dapat menggambarkan aspirin, bergantung pada atom awal yang dipilih. InChI standar bersifat kanonis, sehingga semuanya menghasilkan string identik seperti di atas. Ini menjadikan InChI pilihan yang baik untuk membandingkan struktur dan memeriksa duplikat.
FAQ
Apakah stereokimia disertakan? Ya. @ dan @@ dalam SMILES menjadi lapisan /t, /m, dan /s dalam InChI. Perlu yang lebih pendek? Gunakan SMILES ke InChIKey.
Terakhir diperbarui: