用 ChEMBL 插件从结构图查询药物靶点和生物活性
简短回答：在 Settings › Plugins 中安装 ChEMBL，画出分子（或输入名称或 ChEMBL ID），然后点击 Lookup。你会得到该化合物的 ChEMBL 记录，包括研发阶段、测试过的蛋白靶点、IC50 和 Ki 等活性数据，以及可以加载回画布的相似化合物。
为什么要在绘图时查询生物活性？
单看结构只能告诉你分子是什么，生物活性数据则告诉你它能做什么。无论你是在研究一种药物、设计类似物，还是讲授构效关系，画完结构后的下一个问题通常是：“它测试过吗？针对什么靶点？”
ChEMBL 可以回答这个问题。它是由 EMBL-EBI 运营的免费、人工整理的类药分子数据库，包含数以百万计的实测活性数据点。MolDraw 插件把它带到你的画布旁边，你无需在浏览器标签页之间复制 SMILES。
插件能显示什么
| Overview（概览） | 首选名称、ChEMBL ID、分子类型、最高研发阶段（例如 Approved）和 InChIKey。 |
|---|---|
| Targets（靶点） | 该化合物测试过的蛋白质及其他靶点，每个都链接到相应的 ChEMBL 靶点页面。 |
| Activity（活性） | IC50、Ki 等实测数值，并注明靶点、实验和来源。 |
| 相似 | 来自 ChEMBL 的相似化合物，任意一个都可以加载到画布上。 |
如何安装 ChEMBL 插件
- 打开 MolDraw 编辑器并登录，免费账户即可。
- 点击 Settings（齿轮图标），然后点击 Plugins。
- 点击 ChEMBL 旁边的 Install。分析面板中会出现 ChEMBL 选项卡。
如何查询一个分子
- 画出分子；如果按名称检索，画布可以留空。
- 打开 ChEMBL 选项卡。
- 点击 Use canvas 检索你画的结构，或在查询框中输入名称（aspirin）或 ChEMBL ID（CHEMBL25）。
- 点击 Lookup。
- 浏览 Overview、Targets、Activity 和 Similar。
- 继续处理命中结果：Load to canvas 替换当前图形，Append 把它添加到你的结构旁边，Send to Compare 则在分子比较插件中打开它。
在课堂和实验室中的用法
- 药物发现教学：画一个知名药物，展示它的批准状态和真实靶点，然后打开 Similar，讨论骨架上的微小改变如何影响活性。
- 验证想法：在花时间设计类似物之前，先看看它或与它相近的化合物是否已经测试过。
- 寻找起点：对命中化合物使用 Similar，把几个近邻添加到画布上，并排比较。
- 用经验规则筛选：将结果与 Lipinski 五规则计算器和类药性计算器结合使用。
获得可靠结果的技巧
- 按结构图检索使用的是 InChIKey，属于精确匹配。如果找不到，请检查立体中心、电荷和盐型，或改用名称检索。
- 活性数据来自许多不同的实验，只能在相同实验和条件下进行比较；详情请点击实验链接查看。
- 插件实时读取 ChEMBL，因此需要网络连接。
刚接触化学数据库？我们的免费化学数据库指南介绍了何时使用 ChEMBL、PubChem、ChEBI 等数据库。
常见问题
什么是 ChEMBL？
ChEMBL 是由 EMBL-EBI 运营的免费、人工整理的类药生物活性分子数据库，收录了两百多万个化合物及其针对生物靶点的实测活性。
MolDraw ChEMBL 插件免费吗？
免费。它使用 ChEMBL 的公共 Web 服务，你只需要一个免费的 MolDraw 账户来安装它。
可以通过画结构来检索 ChEMBL 吗？
可以。Use canvas 会按 InChIKey 查找所画的分子，Similar 选项卡则查找相关结构。
为什么找不到我画的分子？
InChIKey 匹配是精确匹配，缺少一个立体中心或电荷、盐型不同都会得到不同的键值。请检查立体化学和电荷，或改用名称或 ChEMBL ID 检索。