XYZ’den SMILES’a Dönüştürücü
Kısaca: Bir XYZ koordinat dosyası yapıştırın veya yükleyin, bağları çıkarın, yapıyı düzenlenebilir 2B tuvale yükleyin ve en iyi tahmin SMILES’ı kopyalayın. Ücretsizdir, web tarayıcınızda çalışır ve indirme gerektirmez.
Bir XYZ koordinat dosyası yapıştırın veya yükleyin, olası bağları çıkarın, sonucu düzenlenebilir 2B tuvale yükleyin ve en iyi tahmin SMILES dizesini kopyalayın.
XYZ Koordinatlarını Girin
SMILES Çıktısı ve Düzenlenebilir Yapı
Editör yükleniyor...Çıkarılan MOL bloğu
Girdi ve çıktı biçimleri
| Girdi: XYZ koordinat dosyası | Çıktı: SMILES | |
|---|---|---|
| Tam adı | XYZ koordinat dosyası | SMILES (Simplified Molecular Input Line Entry System) |
| İçerdiği bilgi | Yalnızca element sembolleri ve x, y, z koordinatları. Bağlar saklanmaz, çıkarılması gerekir. | Atomlar, bağlar, halkalar, yükler ve stereokimya tek satırlık metin olarak. Koordinat içermez. |
| Dosya veya biçim | .xyz | .smi veya düz metin |
XYZ’den SMILES’a Notlar
XYZ dosyaları normalde yalnızca atom sembollerini ve 3B koordinatları saklar. Genellikle bağ derecelerini, formal yükleri, aromatikliği veya stereokimyayı içermez.
Bunu en iyi tahmin yapan bir dönüştürücü olarak kullanın. SMILES’ı veritabanlarında, modelleme araçlarında, yayınlarda veya ödevlerde kullanmadan önce çıkarılan bağları 2B editörde gözden geçirin.
- Editörün normal örtük hidrojenleri kullanabilmesi için karbona bağlı hidrojenler SMILES oluşturulmadan önce gizlenir.
- Bağ dereceleri tek bağ olarak çıkarılır; gerektiğinde çift bağları, aromatik halkaları, yükleri ve stereokimyayı elle düzeltin.
- Önce görsel, düzenlenebilir bir yapı için XYZ / Gaussian’dan 2B Yapıya dönüştürücüyü kullanın.
Son güncelleme: