Convertitore da XYZ a SMILES
In breve: incolla o carica un file di coordinate XYZ, deduci i legami, carica la struttura in un'area 2D modificabile e copia uno SMILES approssimato. È gratuito, funziona nel browser e non richiede download.
Incolla o carica un file di coordinate XYZ, deduci i legami probabili, carica il risultato in un'area 2D modificabile e copia una stringa SMILES approssimata.
Risposta rapida: i file XYZ non memorizzano gli ordini di legame, quindi questo strumento costruisce prima un file MOL dedotto, lascia che l'editor MolDraw riordini il layout 2D e poi legge lo SMILES dalla struttura modificabile.
Coordinate XYZ in ingresso
Pronto. Incolla le coordinate XYZ e converti.
SMILES generato e struttura modificabile
Caricamento dell'editor...Blocco MOL dedotto
Formati di input e output
| Input: file di coordinate XYZ | Output: SMILES | |
|---|---|---|
| Nome completo | File di coordinate XYZ | SMILES (Simplified Molecular Input Line Entry System) |
| Cosa contiene | Solo simboli degli elementi e coordinate x, y, z. I legami non sono memorizzati e devono essere ricavati. | Atomi, legami, anelli, cariche e stereochimica in una sola riga di testo. Nessuna coordinata. |
| File o forma | .xyz | .smi o testo semplice |
Note su XYZ e SMILES
I file XYZ normalmente memorizzano solo i simboli degli atomi e le coordinate 3D. Di solito non includono ordini di legame, cariche formali, aromaticità o stereochimica.
Usalo come convertitore approssimato. Controlla i legami dedotti nell'editor 2D prima di usare lo SMILES in banche dati, strumenti di modellistica, pubblicazioni o compiti.
- Gli idrogeni legati al carbonio vengono nascosti prima della generazione dello SMILES, così l'editor può usare i normali idrogeni impliciti.
- Gli ordini di legame vengono dedotti come legami semplici; correggi a mano doppi legami, anelli aromatici, cariche e stereochimica quando serve.
- Per ottenere prima una struttura visiva modificabile, usa il convertitore da XYZ / Gaussian a struttura 2D.
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