Convertidor de XYZ a SMILES
En resumen: pega o sube un archivo de coordenadas XYZ, deduce los enlaces, carga la estructura en un lienzo 2D editable y copia un SMILES aproximado. Es gratuito, funciona en tu navegador y no requiere descarga.
Pega o sube un archivo de coordenadas XYZ, deduce los enlaces probables, carga el resultado en un lienzo 2D editable y copia una cadena SMILES aproximada.
Respuesta rápida: los archivos XYZ no almacenan órdenes de enlace, así que esta herramienta construye primero un archivo MOL deducido, deja que el editor MolDraw ordene la disposición 2D y después lee el SMILES de la estructura editable.
Coordenadas XYZ de entrada
Listo. Pega las coordenadas XYZ y convierte.
Salida SMILES y estructura editable
Cargando el editor...Bloque MOL deducido
Formatos de entrada y salida
| Entrada: archivo de coordenadas XYZ | Salida: SMILES | |
|---|---|---|
| Nombre completo | Archivo de coordenadas XYZ | SMILES (Simplified Molecular Input Line Entry System) |
| Qué contiene | Solo símbolos de elementos y coordenadas x, y, z. Los enlaces no se almacenan y hay que deducirlos. | Átomos, enlaces, anillos, cargas y estereoquímica en una línea de texto. Sin coordenadas. |
| Archivo o forma | .xyz | .smi o texto plano |
Notas sobre XYZ a SMILES
Los archivos XYZ normalmente solo almacenan los símbolos de los átomos y las coordenadas 3D. No suelen incluir órdenes de enlace, cargas formales, aromaticidad ni estereoquímica.
Úsalo como un convertidor aproximado. Revisa los enlaces deducidos en el editor 2D antes de usar el SMILES en bases de datos, herramientas de modelado, publicaciones o trabajos.
- Los hidrógenos unidos a carbono se ocultan antes de generar el SMILES para que el editor pueda usar los hidrógenos implícitos normales.
- Los órdenes de enlace se deducen como enlaces sencillos; corrige a mano los dobles enlaces, los anillos aromáticos, las cargas y la estereoquímica cuando sea necesario.
- Si primero quieres una estructura visual editable, usa el convertidor de XYZ / Gaussian a estructura 2D.
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