XYZ / Gaussian’dan 2B Yapıya Dönüştürücü

Kısaca: XYZ, Gaussian .gjf, .com veya koordinat metnini yapıştırın ya da yükleyin; bağları çıkarılmış, düzenlenebilir bir 2B molekül yapısı tuvali oluşturun. Ücretsizdir, web tarayıcınızda çalışır ve indirme gerektirmez.

XYZ, Gaussian girdisi veya Kartezyen koordinat metnini yapıştırın ya da yükleyin; bağları çıkarılmış, düzenlenebilir bir 2B yapı tuvali oluşturun.

Kısa cevap: bu araç atom koordinatlarını okur, kovalent yarıçaplardan olası bağları çıkarır, 3B geometriyi 2B’ye izdüşürür, sonucu gömülü editöre yükler ve SVG, PNG veya çıkarılmış bir MOL dosyası olarak dışa aktarır.

Girdi koordinatları

Hazır. Koordinatları yapıştırın ve dönüştürün.

Düzenlenebilir 2B yapı

Editör yükleniyor...
Çıkarılmış yapının statik SVG önizlemesi
2B yapı önizlemesi burada görünür.

Çıkarılmış MOL bloğu

MOL output appears here.

Dosya biçimi açıklaması

XYZ, atom sembollerini ve 3B koordinatları genellikle bağ dereceleri, yükler, aromatiklik veya stereokimya olmadan saklar. Hesaplamalı kimya ve kuantum kimyası iş akışlarında yaygındır.

.gjf ve .com gibi Gaussian girdi dosyaları çoğu zaman bir yük/çokluk satırı ve ardından Kartezyen koordinatlar içerir. Bu araç mümkün olduğunda bu koordinat bloklarını çıkarır.

XYZ ve Gaussian koordinat dosyaları genellikle bağ derecesini saklamadığından çıktı en iyi tahmin niteliğinde bir 2B yapıdır. Yayın, docking veya sonraki kemoinformatik işlemlerinden önce çıkarılan bağları düzeltmek için gömülü 2B tuvali kullanın.

Son güncelleme: