CID’den SMILES’a Dönüştürücü
Kısaca: Kimya çalışmaları için bileşik kimliklerini kanonik SMILES dizelerine çözümleyin. Ücretsizdir, web tarayıcınızda çalışır ve indirme gerektirmez.
PubChem CID değerlerini kanonik SMILES tanımlayıcılarına dönüştürün.
Girdi ve çıktı biçimleri
| Girdi: PubChem CID | Çıktı: SMILES | |
|---|---|---|
| Tam adı | PubChem CID | SMILES (Simplified Molecular Input Line Entry System) |
| Ne içerir | PubChem veritabanındaki bir kaydın Bileşik Kimliği (Compound ID). Yapıyı almak için sorgulanır. | Atomlar, bağlar, halkalar, yükler ve stereokimya tek satırlık metin olarak. Koordinat yok. |
| Dosya veya biçim | 2244 gibi bir tam sayı | .smi veya düz metin |
Dosya biçimi açıklaması
PubChem CID, PubChem tarafından kullanılan sayısal bir bileşik tanımlayıcısıdır. Moleküler yapıyı doğrudan kodlamak yerine bir veritabanı kaydına işaret eder.
SMILES, moleküler bağlantılar için kompakt bir satır gösterimidir. CID’den SMILES’a dönüşüm, bir veritabanı PubChem kimliği verdiğinde ama çizim veya kemoinformatik aracınız bir yapı dizesi beklediğinde kullanışlıdır.
CID sorgusu PubChem kayıtlarına bağlıdır. Farklı bileşik kayıtları, tuzlar, izotoplar veya stereokimyasal formlar farklı CID’lere ve SMILES dizelerine sahip olabilir.
PubChem CID’leri hakkında
PubChem Bileşik Kimliği (CID), PubChem’in veritabanındaki her benzersiz kimyasal yapıya atadığı sayısal tanımlayıcıdır. Örneğin aspirin CID 2244, kafein CID 2519’dur. Makaleler, tedarikçi katalogları ve veri setleri sıklıkla CID’lere atıfta bulunur, ancak tek başına bir sayı size yapıyı söylemez. Onu SMILES’a dönüştürmek size düzenlenebilir bir yapı dizesi verir.
Nasıl kullanılır
- Bir CID girin (yalnızca rakamlar, "CID" öneki olmadan).
- PubChem’den kanonik SMILES’ı almak için dönüştürmeyi çalıştırın.
- SMILES’ı MolDraw’a, bir elektronik tabloya veya başka bir dönüştürücüye kopyalayın.
SSS
CID, CAS numarasıyla aynı mıdır? Hayır. CAS Kayıt Numaraları Chemical Abstracts Service tarafından atanır ve 50-78-2 gibi tireli bir biçime sahiptir; CID’ler PubChem’in kendi sıralı numaralarıdır. Bir tuz neden noktalı SMILES verir? Tuzlar ve karışımlar ayrı bileşenler içerir; SMILES bunları bir noktayla yazar, örneğin [Na+].[Cl-].
Sonraki adımlar: SMILES’tan Yapıya ile çizin veya SMILES’tan InChIKey’e ile bir tanımlayıcı alın.
Son güncelleme: