InChI’den SMILES’a Dönüştürücü
Kısaca: InChI tanımlayıcılarını kanonik SMILES dizelerine dönüştürün. Ücretsizdir, web tarayıcınızda çalışır ve indirme gerektirmez.
Literatürdeki ve veritabanlarındaki InChI dizelerini SMILES biçimine dönüştürün.
Girdi ve çıktı biçimleri
| Girdi: InChI | Çıktı: SMILES | |
|---|---|---|
| Tam adı | InChI (IUPAC International Chemical Identifier) | SMILES (Simplified Molecular Input Line Entry System) |
| İçerdiği bilgi | Yapıdan türetilen katmanlı bir metin tanımlayıcısı. Standart InChI her programda aynıdır. | Atomlar, bağlar, halkalar, yükler ve stereokimya tek satırlık metin olarak. Koordinat içermez. |
| Dosya veya biçim | InChI=1S/ ile başlayan metin | .smi veya düz metin |
Dosya Biçimi Açıklaması
InChI, IUPAC Uluslararası Kimyasal Tanımlayıcısıdır. Katmanlı ve belirlenimcidir; molekül formülünü, bağlantıları, hidrojenleri, yükü, stereokimyayı ve izotopları tanımlamak için kullanışlıdır.
SMILES daha kısadır ve birçok çizim, arama ve kemoinformatik aracına yapıştırmak daha kolaydır. Bir veritabanı InChI verdiğinde ama iş akışınız SMILES beklediğinde InChI’yi SMILES’a dönüştürmek işe yarar.
Farklı servisler aynı InChI için farklı kanonik SMILES döndürebilir. Aynı molekülü tanımlıyorlarsa eşdeğer SMILES dizelerini geçerli kabul edin.
InChI ne zaman SMILES’a dönüştürülür
InChI bir bileşiği tek anlamlı olarak tanımlamak için mükemmeldir, ancak çoğu çizim programı, kemoinformatik betiği ve arama kutusu SMILES bekler. Dönüştürme sayesinde bir veritabanı kaydındaki veya bir makalenin ek verilerindeki tanımlayıcıyı düzenleyip çizebileceğiniz bir şeye çevirebilirsiniz.
Nasıl kullanılır
InChI=1S/ön eki dahil tam bir InChI dizesi yapıştırın.- Dönüştürün, ardından SMILES çıktısını kopyalayın.
- Yapıyı görmek ve düzenlemek için SMILES’ı MolDraw’a yapıştırın.
Örnek
Etanol: InChI=1S/C2H6O/c1-2-3/h3H,2H2,1H3, CCO olur. InChI formülü, bağlantı katmanını (1–2–3 atomları) ve hidrojenlerin yerini listeler; SMILES aynı molekülü üç karakterle ifade eder.
SSS
Stereokimya korunur mu? InChI stereo katmanları (/t, /m, /s veya /b) içeriyorsa bunlar SMILES’taki @ veya / ve \ sembollerine çevrilir. SMILES’ım neden başka bir aracınkinden farklı? Bir molekülün birden çok geçerli SMILES’ı olabilir; ikisini de SMILES’tan InChIKey’e aracıyla InChIKey’e çevirerek karşılaştırın.
Son güncelleme: