立体異性体列挙ツール(2ⁿ則、メソ体、鏡像異性体)
概要:分子を描くか、そのSMILESを貼り付けます。ツールはすべての不斉中心と立体生成二重結合を見つけ、2ⁿ通りの配置をすべて作り、メソ体が1回だけ数えられるよう重複を除き、各異性体にR/SとE/Zの表示を付けて、鏡像異性体の対とジアステレオマーに分類します。
「立体異性体はいくつ?」という問題に答えたり、酒石酸が4つではなく3つである理由を確かめたり、16種のアルドヘキソースをすべて描いたりするのに使えます。SMILESで指定した立体表示はフィルターとして保持され、一致する異性体に印が付きます。
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立体異性体列挙ツールの使い方
- エディタで分子を描くか、SMILESを貼り付けてEnterを押すか、酒石酸などの例を押します。立体表示は任意です。
- 数を確認します:不斉中心と立体生成二重結合の数、上限の2n、そして実際に残る立体異性体の数です。
- 各立体異性体はR/SとE/Zの表示付きで描かれ、キラル、メソ、アキラルのタグが付きます。鏡像異性体は鏡像の対で表示されます。
- 最後の表で、任意の2つの異性体が鏡像異性体かジアステレオマーかがわかります。構造の下のMolDrawで開くを押すと、編集や書き出しができます。
立体異性体の数え方:2n則
不斉中心(立体中心)は通常、4つの異なる基をもつ炭素です。立体生成二重結合は両端にそれぞれ異なる2つの基をもち、EまたはZになり得ます。それぞれに2つの選択肢があるので、n個あれば立体異性体は最大2n個です。
分子が対称な場合、実際の数はそれより少なくなります:
- メソ体。分子の2つの半分が同じ場合、(2R,3S)のような配置は分子内に対称面をもつことがあります。すると鏡像と同一になるため1回だけ数え、光学不活性です。
- 対称なジエン。2,4-ヘキサジエンでは(2E,4Z)と(2Z,4E)が同じ分子なので、異性体は4つではなく3つです。
- 環。cis-1,2-ジメチルシクロヘキサンはメソ体で、trans体は鏡像異性体の対なので、合計3つです。1,4-二置換環にはcisとtransしかなく、R/Sはありません。
| 分子 | n | 2n | 立体異性体 | 理由 |
|---|---|---|---|---|
| 2-ブタノール | 1 | 2 | 2 | 鏡像異性体1対 |
| 2,3-ジブロモペンタン | 2 | 4 | 4 | 両端が異なるのでメソ体はない:2対 |
| 酒石酸、2,3-ブタンジオール、2,3-ジブロモブタン | 2 | 4 | 3 | 1対 + メソ体1つ |
| 2,4-ヘキサジエン | 2 | 4 | 3 | EE、ZZ、EZ(= ZE) |
| 2,3,4-ペンタントリオール | 3 | 8 | 4 | メソ体2つ(C3は擬不斉、r/s)+ 1対 |
| グルコース(鎖状) | 4 | 16 | 16 | D-アルドヘキソース8種とL-アルドヘキソース8種 |
鏡像異性体、ジアステレオマー、メソ化合物
- 鏡像異性体(エナンチオマー)は重ね合わせることのできない鏡像です。すべての不斉中心が反転しています:(2R,3R)と(2S,3S)。平面偏光を回転させる向き以外は、物理的性質が同じです。
- ジアステレオマーは鏡像の関係にない立体異性体です。一部の中心は異なり、一部は同じです:(2R,3R)と(2R,3S)。シス/トランス(E/Z)異性体もジアステレオマーです。融点、沸点、溶解度が異なります。
- メソ化合物は不斉中心をもちますが、分子内の対称面(または対称心)のためにアキラルです。
- エピマーは1つの中心だけが異なるジアステレオマーで、たとえばグルコースとガラクトース(C4)です。
ツールが異性体を見つけるしくみ
すべてのR/SとE/Zの組み合わせを試し、それぞれを立体を考慮した正規コードとして書き出します。同じコードをもつ2つの配置は同じ分子なので、メソ体は1つだけ残り、2つの鏡像異性体は2つのまま残ります。隣接する中心が決まって初めて立体生成的になる中心(擬不斉中心、rまたはsで表示)は、探索を繰り返して見つけます。
例題
2,3-ジブロモブタン
同じ基をもつ2つの不斉中心。(2R,3S)はC2とC3の間に対称面をもちます。
立体異性体3つ:(R,R)、(S,S)、メソ体
トレオニン
C2とC3は異なる基をもつため、メソ体はありえません。天然のL-トレオニンは(2S,3R)で、(2S,3S)はL-アロトレオニンです。
立体異性体4つ、2対
カルボン
不斉中心は1つ(環のC5)。6員環内のC=CはE/Zになりません。
2つ:(R)-カルボン(スペアミント)と(S)-カルボン(キャラウェイ)
1,2-ジメチルシクロヘキサン
cis体は対称面をもつ(メソ体)。trans体はキラル。
3つ:cis(メソ体)+ trans (R,R)/(S,S)
よくある間違い
- 対称な分子で2nをそのまま答えにしてしまう。まずメソ体の有無を確認しましょう。
- E/Z二重結合を見落とす。二重結合も不斉中心と同じくnに数えます。
- 小さな環のC=CをE/Zとして数える。8員環未満の環ではcis(Z)体しか存在できません。
- 対称な分子で(2R,3S)と(2S,3R)を2つの異性体とする。これらは1つのメソ化合物です。
- アミンの窒素を不斉中心として数える。反転が速すぎてRとSを区別できません。
対応元素:C、H、N、O、S、F、Cl、Br、I。水素以外の原子は40個まで、立体異性体は256個まで。
どの立体異性体でも描けます。無料のMolDrawエディタで開くと、くさびと破線を変更したり、3Dで表示したり、画像を書き出したりできます。
MolDrawエディタを開くよくある質問
立体異性体の数はどのように計算しますか?
不斉中心と立体生成二重結合の数(n)を数えます。最大数は2^nです。次に重複を除きます。分子が対称であれば、一部の配置はメソ体または同一になるため、実際の数はそれより少なくなります。
酒石酸には立体異性体がいくつありますか?
3つです。不斉中心が2つあるので配置は2^2 = 4通りですが、(2R,3S)と(2S,3R)は同じメソ化合物です。残りの(R,R)と(S,S)は鏡像異性体の対です。
メソ化合物とは何ですか?
不斉中心をもちながら、分子内に対称面があるためにアキラルな分子です。鏡像と同一で、平面偏光を回転させません。メソ酒石酸やcis-1,2-ジメチルシクロヘキサンがその例です。
鏡像異性体とジアステレオマーの違いは何ですか?
鏡像異性体(エナンチオマー)は互いに鏡像の関係にあり、すべての不斉中心が反転しています。ジアステレオマーは鏡像の関係にない立体異性体で、たとえば(2R,3R)と(2R,3S)です。シス形とトランス形のアルケンもジアステレオマーです。
グルコースには立体異性体がいくつありますか?
鎖状のグルコースには不斉中心が4つ(C2〜C5)あり、対称性がないため、2^4 = 16の立体異性体があります:D-アルドヘキソース8種とL-アルドヘキソース8種です。環状構造ではC1に5つ目の中心(α・βアノマー)が加わります。
二重結合は不斉中心として数えますか?
各炭素に異なる2つの基をもつ二重結合は立体生成的で、E体とZ体を生じるためnに数えます。不斉中心ではありませんが、立体要素です。
立体異性体列挙ツールは無料ですか?
はい。Webブラウザ上で動作し、登録は不要です。
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