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立体異性体列挙ツール(2ⁿ則、メソ体、鏡像異性体)

概要:分子を描くか、そのSMILESを貼り付けます。ツールはすべての不斉中心と立体生成二重結合を見つけ、2ⁿ通りの配置をすべて作り、メソ体が1回だけ数えられるよう重複を除き、各異性体にR/SとE/Zの表示を付けて、鏡像異性体の対とジアステレオマーに分類します。

「立体異性体はいくつ?」という問題に答えたり、酒石酸が4つではなく3つである理由を確かめたり、16種のアルドヘキソースをすべて描いたりするのに使えます。SMILESで指定した立体表示はフィルターとして保持され、一致する異性体に印が付きます。

要点:酒石酸には不斉中心が2つあるので、立体異性体は最大2² = 4です。(2R,3S)と(2S,3R)は同じ分子(メソ体)なので、実際は3つ:(R,R)/(S,S)の鏡像異性体の対とメソ体です。グルコース(鎖状)には不斉中心が4つあり、立体異性体は2⁴ = 16です。

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例:

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立体異性体列挙ツールの使い方

  1. エディタで分子を描くか、SMILESを貼り付けてEnterを押すか、酒石酸などの例を押します。立体表示は任意です。
  2. 数を確認します:不斉中心と立体生成二重結合の数、上限の2n、そして実際に残る立体異性体の数です。
  3. 各立体異性体はR/SとE/Zの表示付きで描かれ、キラル、メソ、アキラルのタグが付きます。鏡像異性体は鏡像の対で表示されます。
  4. 最後の表で、任意の2つの異性体が鏡像異性体かジアステレオマーかがわかります。構造の下のMolDrawで開くを押すと、編集や書き出しができます。

立体異性体の数え方:2n則

不斉中心(立体中心)は通常、4つの異なる基をもつ炭素です。立体生成二重結合は両端にそれぞれ異なる2つの基をもち、EまたはZになり得ます。それぞれに2つの選択肢があるので、n個あれば立体異性体は最大2n個です。

分子が対称な場合、実際の数はそれより少なくなります:

分子n2n立体異性体理由
2-ブタノール122鏡像異性体1対
2,3-ジブロモペンタン244両端が異なるのでメソ体はない:2対
酒石酸、2,3-ブタンジオール、2,3-ジブロモブタン2431対 + メソ体1つ
2,4-ヘキサジエン243EE、ZZ、EZ(= ZE)
2,3,4-ペンタントリオール384メソ体2つ(C3は擬不斉、r/s)+ 1対
グルコース(鎖状)41616D-アルドヘキソース8種とL-アルドヘキソース8種

鏡像異性体、ジアステレオマー、メソ化合物

ツールが異性体を見つけるしくみ

すべてのR/SとE/Zの組み合わせを試し、それぞれを立体を考慮した正規コードとして書き出します。同じコードをもつ2つの配置は同じ分子なので、メソ体は1つだけ残り、2つの鏡像異性体は2つのまま残ります。隣接する中心が決まって初めて立体生成的になる中心(擬不斉中心、rまたはsで表示)は、探索を繰り返して見つけます。

例題

2,3-ジブロモブタン

同じ基をもつ2つの不斉中心。(2R,3S)はC2とC3の間に対称面をもちます。

立体異性体3つ:(R,R)、(S,S)、メソ体

トレオニン

C2とC3は異なる基をもつため、メソ体はありえません。天然のL-トレオニンは(2S,3R)で、(2S,3S)はL-アロトレオニンです。

立体異性体4つ、2対

カルボン

不斉中心は1つ(環のC5)。6員環内のC=CはE/Zになりません。

2つ:(R)-カルボン(スペアミント)と(S)-カルボン(キャラウェイ)

1,2-ジメチルシクロヘキサン

cis体は対称面をもつ(メソ体)。trans体はキラル。

3つ:cis(メソ体)+ trans (R,R)/(S,S)

よくある間違い

対応元素:C、H、N、O、S、F、Cl、Br、I。水素以外の原子は40個まで、立体異性体は256個まで。

どの立体異性体でも描けます。無料のMolDrawエディタで開くと、くさびと破線を変更したり、3Dで表示したり、画像を書き出したりできます。

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よくある質問

立体異性体の数はどのように計算しますか?

不斉中心と立体生成二重結合の数(n)を数えます。最大数は2^nです。次に重複を除きます。分子が対称であれば、一部の配置はメソ体または同一になるため、実際の数はそれより少なくなります。

酒石酸には立体異性体がいくつありますか?

3つです。不斉中心が2つあるので配置は2^2 = 4通りですが、(2R,3S)と(2S,3R)は同じメソ化合物です。残りの(R,R)と(S,S)は鏡像異性体の対です。

メソ化合物とは何ですか?

不斉中心をもちながら、分子内に対称面があるためにアキラルな分子です。鏡像と同一で、平面偏光を回転させません。メソ酒石酸やcis-1,2-ジメチルシクロヘキサンがその例です。

鏡像異性体とジアステレオマーの違いは何ですか?

鏡像異性体(エナンチオマー)は互いに鏡像の関係にあり、すべての不斉中心が反転しています。ジアステレオマーは鏡像の関係にない立体異性体で、たとえば(2R,3R)と(2R,3S)です。シス形とトランス形のアルケンもジアステレオマーです。

グルコースには立体異性体がいくつありますか?

鎖状のグルコースには不斉中心が4つ(C2〜C5)あり、対称性がないため、2^4 = 16の立体異性体があります:D-アルドヘキソース8種とL-アルドヘキソース8種です。環状構造ではC1に5つ目の中心(α・βアノマー)が加わります。

二重結合は不斉中心として数えますか?

各炭素に異なる2つの基をもつ二重結合は立体生成的で、E体とZ体を生じるためnに数えます。不斉中心ではありませんが、立体要素です。

立体異性体列挙ツールは無料ですか?

はい。Webブラウザ上で動作し、登録は不要です。

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