SDF’den InChIKey’e Dönüştürücü
Kısaca: Veritabanı eşleştirmesi için SDF veya MOL bloklarını standart InChIKey tanımlayıcılarına dönüştürün. Ücretsizdir, web tarayıcınızda çalışır ve indirme gerektirmez.
Bir SDF veya MOL bloğu yapıştırın ve standart bir InChIKey’e dönüştürün.
Girdi ve çıktı biçimleri
| Girdi: SDF | Çıktı: InChIKey | |
|---|---|---|
| Tam adı | SDF (Structure Data File) | InChIKey |
| Ne içerir | $$$$ ile ayrılmış, her biri isteğe bağlı veri alanları içeren bir veya daha fazla MOL kaydı. | Web ve veritabanı aramaları için oluşturulmuş, InChI’nin 27 karakterlik bir özetidir (hash). Bir sorgu veritabanı olmadan yapıya geri dönüştürülemez. |
| Dosya veya biçim | .sdf | XXXXXXXXXXXXXX-YYYYYYYYYY-Z gibi metin |
Dosya Biçimi Açıklaması
SDF, atom/bağ bloklarını ve bileşik özelliklerini saklayabilen bir yapı-veri biçimidir. Kimyasal veri kümeleri ve tarama kütüphanelerinde yaygın olarak kullanılır.
InChIKey, bir InChI’den türetilen kısa, özetlenmiş (hash) bir tanımlayıcıdır. Özellikle veritabanı eşleştirme, dizinleme ve iki kaydın büyük olasılıkla aynı bileşiği tanımlayıp tanımlamadığını kontrol etmek için kullanışlıdır.
InChIKey arama dostudur ancak tamamen geri döndürülebilir değildir. Koordinatlara, atom bloklarına veya özellik alanlarına daha sonra ihtiyacınız olacaksa kaynak SDF’yi saklayın.
Bileşik kütüphanelerinde InChIKey kullanımı
Bir bileşik kütüphanesini SDF olarak aldığınızda, her kayıt için bir InChIKey size yapının kısa ve aranabilir bir parmak izini verir. Anahtarlar elektronik tablolara ve veritabanlarına kolayca sığar ve farklı adlar veya kimlikler altında listelenen aynı bileşiği fark etmeyi kolaylaştırır.
Nasıl kullanılır
- Her biri
$$$$ile biten bir veya daha fazla SDF kaydını kopyalayın. - Yapıştırın ve dönüştürün.
- Elde edilen 27 karakterlik anahtarları elektronik tablonuzda bileşik kimliklerinin yanına kopyalayın.
Pratik kullanımlar
- Yinelenenleri ayıklama: InChIKey’e göre sıralayın; aynı anahtarlar stereokimya dahil aynı yapıyı gösterir.
- Stereoizomerleri bulma: aynı iskeleti paylaşan ancak stereokimya veya izotoplar açısından farklı olan bileşikleri toplamak için ilk 14 karakterlik bloğa göre gruplayın.
- Çapraz referans: literatür, tedarikçi veya güvenlik verisi bulmak için anahtarları herkese açık veritabanlarında arayın.
Not: SDF kayıtlarındaki tuzlar ve karışımlar kaydın tamamı için anahtar üretir; bu nedenle bir hidroklorür tuzu ile serbest bazının anahtarları farklıdır. Ana bileşikleri eşleştirmek istiyorsanız önce karşı iyonları çıkarın. Tam tanımlayıcı için SDF’den InChI’ye aracını kullanın.
Son güncelleme: