Conversor de SDF em InChIKey
Em resumo: Converta blocos SDF ou MOL em identificadores InChIKey padrão para correspondência em bancos de dados. É gratuito, funciona no seu navegador e não precisa de download.
Cole um bloco SDF ou MOL e converta-o em uma InChIKey padrão.
Formatos de entrada e saída
| Entrada: SDF | Saída: InChIKey | |
|---|---|---|
| Nome completo | SDF (Structure Data File) | InChIKey |
| O que contém | Um ou mais registros MOL, cada um com campos de dados opcionais, separados por $$$$. | Um hash de 27 caracteres do InChI, criado para buscas na web e em bancos de dados. Não pode ser convertido de volta em estrutura sem um banco de dados de consulta. |
| Arquivo ou forma | .sdf | Texto como XXXXXXXXXXXXXX-YYYYYYYYYY-Z |
Formatos de arquivo explicados
SDF é um formato de dados de estrutura que pode armazenar blocos de átomos/ligações e propriedades dos compostos. É muito usado em conjuntos de dados químicos e bibliotecas de triagem.
InChIKey é um identificador compacto em hash derivado de um InChI. É especialmente útil para correspondência em bancos de dados, indexação e para verificar se dois registros provavelmente descrevem o mesmo composto.
A InChIKey é ótima para buscas, mas não é totalmente reversível. Guarde o SDF original se precisar depois das coordenadas, dos blocos de átomos ou dos campos de propriedades.
Usando InChIKeys com bibliotecas de compostos
Quando você recebe uma biblioteca de compostos em SDF, uma InChIKey para cada registro dá uma impressão digital curta e pesquisável da estrutura. As chaves cabem bem em planilhas e bancos de dados e facilitam encontrar o mesmo composto listado com nomes ou IDs diferentes.
Como usar
- Copie um ou mais registros SDF, cada um terminando com
$$$$. - Cole e converta.
- Copie as chaves de 27 caracteres resultantes para sua planilha, ao lado dos IDs dos compostos.
Usos práticos
- Remoção de duplicatas: ordene por InChIKey; chaves idênticas indicam a mesma estrutura, incluindo a estereoquímica.
- Encontrar estereoisômeros: agrupe pelo primeiro bloco de 14 caracteres para reunir compostos que têm o mesmo esqueleto, mas diferem na estereoquímica ou nos isótopos.
- Referências cruzadas: busque as chaves em bancos de dados públicos para encontrar literatura, fornecedores ou dados de segurança.
Observação: sais e misturas em registros SDF geram chaves para o registro inteiro, então um cloridrato e sua base livre têm chaves diferentes. Remova os contraíons antes se quiser comparar os compostos de origem. Para o identificador completo, use SDF para InChI.
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