เครื่องมือแปลง SDF เป็น InChIKey

สรุปสั้น ๆ: แปลงบล็อก SDF หรือ MOL เป็นตัวระบุ InChIKey มาตรฐานสำหรับการจับคู่ในฐานข้อมูล ใช้งานฟรี ทำงานในเว็บเบราว์เซอร์ และไม่ต้องดาวน์โหลด

วางบล็อก SDF หรือ MOL แล้วแปลงเป็น InChIKey มาตรฐาน

อธิบายรูปแบบไฟล์

SDF เป็นรูปแบบข้อมูลโครงสร้างที่เก็บบล็อกอะตอม/พันธะและสมบัติของสารประกอบได้ ใช้กันอย่างแพร่หลายสำหรับชุดข้อมูลสารเคมีและคลังสารสำหรับการคัดกรอง

InChIKey เป็นตัวระบุแบบแฮชขนาดกะทัดรัดที่ได้จาก InChI มีประโยชน์อย่างยิ่งสำหรับการจับคู่ในฐานข้อมูล การทำดัชนี และการตรวจว่าระเบียนสองรายการน่าจะเป็นสารประกอบเดียวกันหรือไม่

InChIKey ค้นหาได้ง่ายแต่แปลงกลับไม่ได้ทั้งหมด เก็บไฟล์ SDF ต้นฉบับไว้หากต้องการพิกัด บล็อกอะตอม หรือฟิลด์สมบัติในภายหลัง

การใช้ InChIKey กับคลังสารประกอบ

เมื่อได้รับคลังสารประกอบเป็นไฟล์ SDF การมี InChIKey ของแต่ละระเบียนให้ลายพิมพ์ของโครงสร้างที่สั้นและค้นหาได้ คีย์ใส่ในสเปรดชีตและฐานข้อมูลได้พอดี และช่วยให้เห็นสารประกอบเดียวกันที่อยู่ในรายการภายใต้ชื่อหรือ ID ต่างกันได้ง่าย

วิธีใช้

1. คัดลอกระเบียน SDF หนึ่งระเบียนหรือมากกว่า โดยแต่ละระเบียนลงท้ายด้วย $$$$
2. วางแล้วแปลง
3. คัดลอกคีย์ 27 ตัวอักษรที่ได้ลงในสเปรดชีตข้าง ID ของสารประกอบ

การใช้งานจริง

• การตัดรายการซ้ำ: เรียงตาม InChIKey คีย์ที่เหมือนกันแสดงว่าเป็นโครงสร้างเดียวกัน รวมถึงสเตอริโอเคมี
• การหาสเตอริโอไอโซเมอร์: จัดกลุ่มตามบล็อก 14 ตัวอักษรแรก เพื่อรวบรวมสารประกอบที่มีโครงร่างเดียวกันแต่ต่างกันที่สเตอริโอหรือไอโซโทป
• การอ้างอิงข้าม: ค้นหาคีย์ในฐานข้อมูลสาธารณะเพื่อหาเอกสาร ผู้จำหน่าย หรือข้อมูลความปลอดภัย

หมายเหตุ: เกลือและของผสมในระเบียน SDF จะให้คีย์ของทั้งระเบียน เกลือไฮโดรคลอไรด์กับเบสอิสระจึงมีคีย์ต่างกัน ให้ตัดไอออนตรงข้ามออกก่อนหากต้องการจับคู่สารประกอบหลัก สำหรับตัวระบุฉบับเต็ม ใช้SDF เป็น InChI