Convertidor de SDF a InChIKey
En resumen: convierte bloques SDF o MOL en identificadores InChIKey estándar para cotejar bases de datos. Es gratuito, funciona en tu navegador y no requiere descargas.
Pega un bloque SDF o MOL y conviértelo en un InChIKey estándar.
Formatos de entrada y salida
| Entrada: SDF | Salida: InChIKey | |
|---|---|---|
| Nombre completo | SDF (Structure Data File) | InChIKey |
| Qué contiene | Uno o varios registros MOL, cada uno con campos de datos opcionales, separados por $$$$. | Un hash de 27 caracteres del InChI, pensado para búsquedas web y en bases de datos. No puede convertirse de nuevo en una estructura sin una base de datos de consulta. |
| Archivo o forma | .sdf | Texto del tipo XXXXXXXXXXXXXX-YYYYYYYYYY-Z |
Formatos de archivo
SDF es un formato de datos estructurales que puede almacenar bloques de átomos y enlaces y propiedades de los compuestos. Se usa mucho en conjuntos de datos químicos y quimiotecas de cribado.
InChIKey es un identificador compacto con hash derivado de un InChI. Es especialmente útil para cotejar bases de datos, indexar y comprobar si dos registros describen probablemente el mismo compuesto.
InChIKey es fácil de buscar, pero no es totalmente reversible. Conserva el SDF de origen si más adelante necesitas coordenadas, bloques de átomos o campos de propiedades.
Uso de InChIKey con quimiotecas
Cuando recibes una quimioteca en formato SDF, un InChIKey por registro te da una huella corta y buscable de cada estructura. Las claves caben bien en hojas de cálculo y bases de datos, y facilitan detectar el mismo compuesto registrado con nombres o ID diferentes.
Cómo usarlo
- Copia uno o varios registros SDF, cada uno terminado en
$$$$. - Pega y convierte.
- Copia las claves de 27 caracteres resultantes en tu hoja de cálculo junto a los ID de los compuestos.
Usos prácticos
- Eliminación de duplicados: ordena por InChIKey; las claves idénticas indican la misma estructura, estereoquímica incluida.
- Búsqueda de estereoisómeros: agrupa por el primer bloque de 14 caracteres para reunir compuestos que comparten esqueleto pero difieren en estereoquímica o isótopos.
- Referencias cruzadas: busca las claves en bases de datos públicas para encontrar bibliografía, proveedores o datos de seguridad.
Nota: las sales y mezclas de los registros SDF generan claves para el registro completo, de modo que un clorhidrato y su base libre tienen claves distintas. Elimina primero los contraiones si quieres cotejar los compuestos parentales. Para el identificador completo, usa SDF a InChI.
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