Konverter SDF ke InChIKey
Singkatnya: Ubah blok SDF atau MOL menjadi pengenal InChIKey standar untuk pencocokan basis data. Gratis, berjalan di peramban web Anda, dan tidak perlu diunduh.
Tempel blok SDF atau MOL dan ubah menjadi InChIKey standar.
Format masukan dan keluaran
| Masukan: SDF | Keluaran: InChIKey | |
|---|---|---|
| Nama lengkap | SDF (Structure Data File) | InChIKey |
| Isi data | Satu atau beberapa rekaman MOL, masing-masing dengan kolom data opsional, dipisahkan oleh $$$$. | Hash InChI sepanjang 27 karakter, dibuat untuk pencarian web dan basis data. Kunci ini tidak dapat diubah kembali menjadi struktur tanpa basis data pencarian. |
| File atau bentuk | .sdf | Teks seperti XXXXXXXXXXXXXX-YYYYYYYYYY-Z |
Penjelasan Format File
SDF adalah format data struktur yang dapat menyimpan blok atom/ikatan dan sifat senyawa. Format ini banyak digunakan untuk kumpulan data kimia dan pustaka penapisan.
InChIKey adalah pengenal ringkas berbentuk hash yang diturunkan dari InChI. Pengenal ini sangat berguna untuk pencocokan basis data, pengindeksan, dan memeriksa apakah dua rekaman kemungkinan menggambarkan senyawa yang sama.
InChIKey mudah dicari tetapi tidak sepenuhnya dapat dibalik. Simpan SDF sumbernya jika nanti Anda memerlukan koordinat, blok atom, atau kolom sifat.
Menggunakan InChIKey dengan pustaka senyawa
Saat Anda menerima pustaka senyawa dalam bentuk SDF, InChIKey untuk setiap rekaman memberi Anda sidik jari struktur yang pendek dan mudah dicari. Kunci ini pas di spreadsheet dan basis data, serta memudahkan Anda menemukan senyawa yang sama yang tercantum dengan nama atau ID berbeda.
Cara menggunakannya
- Salin satu atau beberapa rekaman SDF, masing-masing diakhiri dengan
$$$$. - Tempel lalu lakukan konversi.
- Salin kunci 27 karakter yang dihasilkan ke spreadsheet Anda di samping ID senyawa.
Kegunaan praktis
- Deduplikasi: urutkan berdasarkan InChIKey; kunci yang identik menunjukkan struktur yang sama, termasuk stereokimianya.
- Menemukan stereoisomer: kelompokkan berdasarkan blok 14 karakter pertama untuk mengumpulkan senyawa yang memiliki kerangka sama tetapi berbeda stereo atau isotopnya.
- Referensi silang: cari kunci di basis data publik untuk menemukan literatur, pemasok, atau data keselamatan.
Catatan: garam dan campuran dalam rekaman SDF menghasilkan kunci untuk seluruh rekaman, sehingga garam hidroklorida dan basa bebasnya memiliki kunci berbeda. Hapus ion lawan terlebih dahulu jika Anda ingin mencocokkan senyawa induk. Untuk pengenal lengkap, gunakan SDF ke InChI.
Terakhir diperbarui: