محوّل SDF إلى InChIKey
باختصار: حوّل كتل SDF أو MOL إلى معرّفات InChIKey القياسية للمطابقة في قواعد البيانات. الأداة مجانية وتعمل في متصفح الويب ولا تحتاج إلى تنزيل.
الصق كتلة SDF أو MOL وحوّلها إلى InChIKey قياسي.
صيغ الإدخال والإخراج
| الإدخال: SDF | الإخراج: InChIKey | |
|---|---|---|
| الاسم الكامل | SDF (ملف بيانات البنية) | InChIKey |
| ما تحتويه | سجل MOL واحد أو أكثر، لكلٍّ منها حقول بيانات اختيارية، مفصولة بـ $$$$. | تجزئة (hash) من 27 حرفًا لـ InChI، مصممة للبحث على الويب وفي قواعد البيانات. ولا يمكن إرجاعها إلى بنية دون قاعدة بيانات للبحث. |
| الملف أو الشكل | .sdf | نص مثل XXXXXXXXXXXXXX-YYYYYYYYYY-Z |
شرح صيغة الملف
SDF صيغة لبيانات البنى يمكنها تخزين كتل الذرات/الروابط وخصائص المركبات. وتُستخدم على نطاق واسع لمجموعات البيانات الكيميائية ومكتبات الفحص.
InChIKey معرّف مدمج مُجزّأ مشتق من InChI. وهو مفيد خاصةً للمطابقة في قواعد البيانات والفهرسة والتحقق مما إذا كان سجلان يصفان على الأرجح المركب نفسه.
InChIKey مناسب للبحث لكنه غير قابل للعكس تمامًا. احتفظ بملف SDF المصدر إذا احتجت لاحقًا إلى الإحداثيات أو كتل الذرات أو حقول الخصائص.
استخدام InChIKey مع مكتبات المركبات
عندما تتلقى مكتبة مركبات بصيغة SDF، يمنحك InChIKey لكل سجل بصمة قصيرة قابلة للبحث للبنية. وتتلاءم المفاتيح بسهولة مع جداول البيانات وقواعد البيانات، وتسهّل اكتشاف المركب نفسه المدرج بأسماء أو معرّفات مختلفة.
طريقة الاستخدام
- انسخ سجلًا واحدًا أو أكثر من SDF، ينتهي كلٌّ منها بـ
$$$$. - الصق وحوّل.
- انسخ المفاتيح الناتجة المكوّنة من 27 حرفًا إلى جدول بياناتك بجانب معرّفات المركبات.
استخدامات عملية
- إزالة المكررات: رتّب حسب InChIKey؛ فالمفاتيح المتطابقة تدل على البنية نفسها، بما فيها الكيمياء الفراغية.
- العثور على المتصاوغات الفراغية: جمّع حسب الكتلة الأولى المكوّنة من 14 حرفًا لتجمع المركبات التي تشترك في الهيكل وتختلف في الكيمياء الفراغية أو النظائر.
- المراجعة المتقاطعة: ابحث عن المفاتيح في قواعد البيانات العامة للعثور على المراجع أو الموردين أو بيانات السلامة.
ملاحظة: تنتج الأملاح والمخاليط في سجلات SDF مفاتيح للسجل كاملًا، لذا يختلف مفتاح ملح الهيدروكلوريد عن مفتاح قاعدته الحرة. أزل الأيونات المضادة أولًا إذا أردت مطابقة المركبات الأم. وللمعرّف الكامل استخدم SDF إلى InChI.
آخر تحديث: