Convertitore da SDF a InChIKey
In breve: converti blocchi SDF o MOL in identificatori InChIKey standard per il confronto nei database. È gratuito, funziona nel browser web e non richiede download.
Incolla un blocco SDF o MOL e convertilo in un InChIKey standard.
Formati di input e output
| Input: SDF | Output: InChIKey | |
|---|---|---|
| Nome completo | SDF (Structure Data File) | InChIKey |
| Cosa contiene | Uno o più record MOL, ognuno con campi dati facoltativi, separati da $$$$. | Un hash di 27 caratteri dell'InChI, pensato per la ricerca web e nei database. Non può essere riconvertito in struttura senza un database di consultazione. |
| File o forma | .sdf | Testo come XXXXXXXXXXXXXX-YYYYYYYYYY-Z |
Formati di file spiegati
L'SDF è un formato di dati strutturali che può memorizzare blocchi di atomi/legami e proprietà dei composti. È molto usato per dataset chimici e librerie di screening.
L'InChIKey è un identificatore compatto in forma di hash derivato da un InChI. È particolarmente utile per il confronto nei database, l'indicizzazione e per verificare se due record descrivono probabilmente lo stesso composto.
L'InChIKey è comodo per la ricerca ma non completamente reversibile. Conserva l'SDF di origine se in seguito ti servono coordinate, blocchi di atomi o campi di proprietà.
Usare gli InChIKey con le librerie di composti
Quando ricevi una libreria di composti in SDF, un InChIKey per ogni record ti dà un'impronta breve e ricercabile della struttura. Le chiavi stanno bene in fogli di calcolo e database e rendono facile individuare lo stesso composto elencato con nomi o ID diversi.
Come si usa
- Copia uno o più record SDF, ognuno terminante con
$$$$. - Incolla e converti.
- Copia le chiavi di 27 caratteri ottenute nel tuo foglio di calcolo accanto agli ID dei composti.
Usi pratici
- Eliminazione dei duplicati: ordina per InChIKey; chiavi identiche indicano la stessa struttura, stereochimica compresa.
- Trovare stereoisomeri: raggruppa per il primo blocco di 14 caratteri per riunire composti che condividono lo scheletro ma differiscono per stereochimica o isotopi.
- Riferimenti incrociati: cerca le chiavi nei database pubblici per trovare letteratura, fornitori o dati di sicurezza.
Nota: sali e miscele nei record SDF producono chiavi per l'intero record, quindi un sale cloridrato e la sua base libera hanno chiavi diverse. Rimuovi prima i controioni se vuoi confrontare i composti progenitori. Per l'identificatore completo, usa da SDF a InChI.
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