Conversor de CID em SMILES
Em resumo: converta IDs de compostos em strings SMILES canônicas para fluxos de trabalho em química. É gratuito, funciona no navegador e não precisa de download.
Converta valores de CID do PubChem em identificadores SMILES canônicos.
Formatos de entrada e saída
| Entrada: CID do PubChem | Saída: SMILES | |
|---|---|---|
| Nome completo | CID do PubChem | SMILES (Simplified Molecular Input Line Entry System) |
| O que contém | O Compound ID de um registro no banco de dados PubChem. Ele é consultado para obter a estrutura. | Átomos, ligações, anéis, cargas e estereoquímica em uma única linha de texto. Sem coordenadas. |
| Arquivo ou forma | Um número inteiro, como 2244 | .smi ou texto simples |
Formatos de arquivo explicados
O CID do PubChem é um identificador numérico de compostos usado pelo PubChem. Ele aponta para um registro do banco de dados em vez de codificar diretamente a estrutura molecular.
O SMILES é uma notação linear compacta da conectividade molecular. Converter CID em SMILES é útil quando um banco de dados fornece um ID do PubChem, mas sua ferramenta de desenho ou de quimioinformática espera uma string de estrutura.
A consulta do CID depende dos registros do PubChem. Registros de compostos diferentes, sais, isótopos ou formas estereoquímicas podem ter CIDs e strings SMILES diferentes.
Sobre os CIDs do PubChem
Um Compound ID (CID) do PubChem é o identificador numérico que o PubChem atribui a cada estrutura química única do seu banco de dados. Por exemplo, a aspirina é o CID 2244 e a cafeína é o CID 2519. Artigos, catálogos de fornecedores e conjuntos de dados costumam citar CIDs, mas um número sozinho não diz qual é a estrutura. Convertê-lo em SMILES fornece uma string de estrutura editável.
Como usar
- Digite um CID (só dígitos, sem o prefixo "CID").
- Execute a conversão para obter o SMILES canônico do PubChem.
- Copie o SMILES para o MolDraw, uma planilha ou outro conversor.
Perguntas frequentes
Um CID é o mesmo que um número CAS? Não. Os números de registro CAS são atribuídos pelo Chemical Abstracts Service e têm formato com hifens, como 50-78-2; os CIDs são números sequenciais do próprio PubChem. Por que um sal dá um SMILES com ponto? Sais e misturas contêm componentes separados, que o SMILES escreve com um ponto, por exemplo [Na+].[Cl-].
Próximos passos: desenhe-o com SMILES para estrutura ou obtenha um identificador com SMILES para InChIKey.
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