Konverter CID ke SMILES
Singkatnya: Ubah ID senyawa menjadi string SMILES kanonis untuk alur kerja kimia. Gratis, berjalan di peramban web Anda, dan tidak perlu diunduh.
Ubah nilai CID PubChem menjadi pengenal SMILES kanonis.
Format masukan dan keluaran
| Masukan: CID PubChem | Keluaran: SMILES | |
|---|---|---|
| Nama lengkap | CID PubChem | SMILES (Simplified Molecular Input Line Entry System) |
| Isi data | ID Senyawa (Compound ID) suatu catatan dalam basis data PubChem. ID ini dicari untuk mendapatkan strukturnya. | Atom, ikatan, cincin, muatan, dan stereo dalam satu baris teks. Tanpa koordinat. |
| File atau bentuk | Bilangan bulat seperti 2244 | .smi atau teks biasa |
Penjelasan Format File
CID PubChem adalah pengenal senyawa berupa angka yang digunakan PubChem. CID menunjuk ke catatan basis data, bukan menyandikan struktur molekul secara langsung.
SMILES adalah notasi baris ringkas untuk konektivitas molekul. Mengubah CID menjadi SMILES berguna ketika basis data memberikan ID PubChem tetapi alat gambar atau keminformatika Anda memerlukan string struktur.
Pencarian CID bergantung pada catatan PubChem. Catatan senyawa, garam, isotop, atau bentuk stereokimia yang berbeda dapat memiliki CID dan string SMILES yang berbeda.
Tentang CID PubChem
Compound ID (CID) PubChem adalah pengenal berupa angka yang diberikan PubChem untuk setiap struktur kimia unik dalam basis datanya. Misalnya, aspirin adalah CID 2244 dan kafein adalah CID 2519. Makalah, katalog pemasok, dan dataset sering mencantumkan CID, tetapi angka saja tidak memberi tahu strukturnya. Mengubahnya menjadi SMILES memberi Anda string struktur yang dapat diedit.
Cara menggunakannya
- Masukkan satu CID (hanya angka, tanpa awalan "CID").
- Jalankan konversi untuk mengambil SMILES kanonis dari PubChem.
- Salin SMILES ke MolDraw, spreadsheet, atau konverter lain.
FAQ
Apakah CID sama dengan nomor CAS? Tidak. Nomor Registri CAS diberikan oleh Chemical Abstracts Service dan berformat dengan tanda hubung seperti 50-78-2; CID adalah nomor urut milik PubChem sendiri. Mengapa garam menghasilkan SMILES bertitik? Garam dan campuran mengandung komponen terpisah, yang ditulis SMILES dengan titik, misalnya [Na+].[Cl-].
Langkah berikutnya: gambar dengan SMILES ke Struktur atau dapatkan pengenal dengan SMILES ke InChIKey.
Terakhir diperbarui: