Konwerter CID na SMILES
W skrócie: Przekształcaj identyfikatory związków w kanoniczne ciągi SMILES do pracy chemicznej. Jest darmowy, działa w przeglądarce i nie wymaga pobierania.
Konwertuj wartości PubChem CID na kanoniczne identyfikatory SMILES.
Formaty wejściowe i wyjściowe
| Wejście: PubChem CID | Wynik: SMILES | |
|---|---|---|
| Pełna nazwa | PubChem CID | SMILES (Simplified Molecular Input Line Entry System) |
| Co zawiera | Identyfikator związku (Compound ID) rekordu w bazie PubChem. Na jego podstawie pobierana jest struktura. | Atomy, wiązania, pierścienie, ładunki i stereochemię w jednym wierszu tekstu. Bez współrzędnych. |
| Plik lub forma | Liczba całkowita, np. 2244 | .smi lub zwykły tekst |
Formaty plików w skrócie
PubChem CID to liczbowy identyfikator związku używany przez PubChem. Wskazuje rekord w bazie danych, a nie koduje bezpośrednio struktury cząsteczki.
SMILES to zwarta notacja liniowa opisująca połączenia w cząsteczce. Konwersja CID na SMILES przydaje się, gdy baza danych podaje identyfikator PubChem, a Twoje narzędzie do rysowania lub chemoinformatyki oczekuje ciągu opisującego strukturę.
Wyszukiwanie CID zależy od rekordów PubChem. Różne rekordy związków, sole, izotopy lub formy stereochemiczne mogą mieć różne CID i ciągi SMILES.
O identyfikatorach PubChem CID
PubChem Compound ID (CID) to liczbowy identyfikator, który PubChem nadaje każdej unikalnej strukturze chemicznej w swojej bazie. Na przykład aspiryna ma CID 2244, a kofeina CID 2519. Publikacje, katalogi dostawców i zbiory danych często podają CID, ale sama liczba nie mówi nic o strukturze. Konwersja na SMILES daje edytowalny ciąg opisujący strukturę.
Jak z niego korzystać
- Wpisz jeden CID (same cyfry, bez przedrostka „CID”).
- Uruchom konwersję, aby pobrać kanoniczny SMILES z PubChem.
- Skopiuj SMILES do MolDraw, arkusza kalkulacyjnego lub innego konwertera.
FAQ
Czy CID to to samo co numer CAS? Nie. Numery rejestru CAS nadaje Chemical Abstracts Service i mają format z łącznikami, np. 50-78-2; CID to kolejne numery nadawane przez PubChem. Dlaczego sól daje SMILES z kropką? Sole i mieszaniny zawierają oddzielne składniki, które SMILES zapisuje z kropką, np. [Na+].[Cl-].
Dalsze kroki: narysuj go za pomocą SMILES na strukturę lub uzyskaj identyfikator za pomocą SMILES na InChIKey.
Ostatnia aktualizacja: