محوّل CID إلى SMILES
باختصار: حوّل معرّفات المركبات إلى سلاسل SMILES موحّدة لأعمالك الكيميائية. الأداة مجانية وتعمل في متصفح الويب دون الحاجة إلى تنزيل.
حوّل قيم PubChem CID إلى معرّفات SMILES موحّدة.
صيغ الإدخال والإخراج
| الإدخال: PubChem CID | الإخراج: SMILES | |
|---|---|---|
| الاسم الكامل | PubChem CID | SMILES (Simplified Molecular Input Line Entry System) |
| ما الذي تحتويه | معرّف المركب (Compound ID) لسجل في قاعدة بيانات PubChem. يُبحث عنه للحصول على البنية. | الذرات والروابط والحلقات والشحنات والكيمياء الفراغية في سطر نصي واحد. دون إحداثيات. |
| الملف أو الشكل | عدد صحيح مثل 2244 | ملف .smi أو نص عادي |
شرح صيغة الملف
PubChem CID معرّف رقمي للمركبات يستخدمه PubChem. وهو يشير إلى سجل في قاعدة البيانات ولا يرمّز البنية الجزيئية مباشرة.
SMILES ترميز خطي مختصر لترابط الذرات في الجزيء. ويفيد تحويل CID إلى SMILES عندما تعطيك قاعدة بيانات رقم PubChem بينما تتوقع أداة الرسم أو المعلوماتية الكيميائية سلسلة بنية.
يعتمد البحث عن CID على سجلات PubChem. وقد يكون لسجلات المركبات المختلفة أو الأملاح أو النظائر أو الصور الفراغية أرقام CID وسلاسل SMILES مختلفة.
عن أرقام PubChem CID
معرّف المركب في PubChem (CID) هو الرقم الذي يمنحه PubChem لكل بنية كيميائية فريدة في قاعدة بياناته. فمثلًا الأسبرين هو CID 2244 والكافيين هو CID 2519. كثيرًا ما تذكر الأبحاث وكتالوجات الموردين ومجموعات البيانات أرقام CID، لكن الرقم وحده لا يخبرك بالبنية. وتحويله إلى SMILES يمنحك سلسلة بنية قابلة للتحرير.
طريقة الاستخدام
- أدخل رقم CID واحدًا (أرقامًا فقط، دون البادئة "CID").
- شغّل التحويل لجلب SMILES الموحّد من PubChem.
- انسخ SMILES إلى MolDraw أو إلى جدول بيانات أو إلى محوّل آخر.
الأسئلة الشائعة
هل رقم CID هو نفسه رقم CAS؟ لا. تمنح أرقامَ تسجيل CAS خدمةُ Chemical Abstracts Service، وتكون بصيغة تتضمن شرطات مثل 50-78-2؛ أما أرقام CID فهي أرقام PubChem التسلسلية الخاصة. لماذا يعطي الملح SMILES فيه نقطة؟ تحتوي الأملاح والمخاليط على مكوّنات منفصلة يكتبها SMILES مفصولة بنقطة، مثل [Na+].[Cl-].
الخطوات التالية: ارسمه باستخدام SMILES إلى بنية أو احصل على معرّف باستخدام SMILES إلى InChIKey.
آخر تحديث: