เครื่องมือแปลง CID เป็น SMILES
สรุปสั้น ๆ: แปลงรหัสสารประกอบเป็นสตริง SMILES แบบแคนอนิคัลสำหรับงานเคมี ใช้งานฟรี ทำงานในเว็บเบราว์เซอร์ และไม่ต้องดาวน์โหลด
แปลงค่า PubChem CID เป็นตัวระบุ SMILES แบบแคนอนิคัล
รูปแบบอินพุตและเอาต์พุต
| อินพุต: PubChem CID | เอาต์พุต: SMILES | |
|---|---|---|
| ชื่อเต็ม | PubChem CID | SMILES (Simplified Molecular Input Line Entry System) |
| ข้อมูลที่เก็บ | รหัสสารประกอบ (Compound ID) ของระเบียนในฐานข้อมูล PubChem ใช้ค้นหาเพื่อดึงโครงสร้าง | อะตอม พันธะ วง ประจุ และสเตอริโอเคมีในข้อความบรรทัดเดียว ไม่มีพิกัด |
| ไฟล์หรือรูปแบบ | จำนวนเต็ม เช่น 2244 | .smi หรือข้อความธรรมดา |
อธิบายรูปแบบไฟล์
PubChem CID เป็นตัวระบุสารประกอบแบบตัวเลขที่ PubChem ใช้ ชี้ไปยังระเบียนในฐานข้อมูล ไม่ได้เข้ารหัสโครงสร้างโมเลกุลโดยตรง
SMILES เป็นสัญกรณ์บรรทัดเดียวที่กะทัดรัดสำหรับการเชื่อมต่อของโมเลกุล การแปลง CID เป็น SMILES มีประโยชน์เมื่อฐานข้อมูลให้รหัส PubChem แต่เครื่องมือวาดหรือเครื่องมือเคมีสารสนเทศของคุณต้องการสตริงโครงสร้าง
การค้นหา CID ขึ้นกับระเบียนของ PubChem ระเบียนสารประกอบ เกลือ ไอโซโทป หรือรูปแบบสเตอริโอเคมีที่ต่างกันอาจมี CID และสตริง SMILES ต่างกัน
เกี่ยวกับ PubChem CID
PubChem Compound ID (CID) คือรหัสตัวเลขที่ PubChem กำหนดให้แต่ละโครงสร้างเคมีที่ไม่ซ้ำกันในฐานข้อมูล เช่น แอสไพรินคือ CID 2244 และคาเฟอีนคือ CID 2519 บทความ แคตตาล็อกผู้จำหน่าย และชุดข้อมูลมักอ้างอิง CID แต่ตัวเลขเพียงอย่างเดียวไม่ได้บอกโครงสร้าง การแปลงเป็น SMILES ทำให้ได้สตริงโครงสร้างที่แก้ไขได้
วิธีใช้
- ใส่ CID หนึ่งค่า (ตัวเลขเท่านั้น ไม่ต้องใส่ "CID" นำหน้า)
- เริ่มแปลงเพื่อดึง SMILES แบบแคนอนิคัลจาก PubChem
- คัดลอก SMILES ไปใช้ใน MolDraw สเปรดชีต หรือเครื่องมือแปลงอื่น
คำถามพบบ่อย
CID เหมือนกับเลข CAS หรือไม่? ไม่ เลขทะเบียน CAS กำหนดโดย Chemical Abstracts Service และมีรูปแบบที่มีขีด เช่น 50-78-2 ส่วน CID เป็นเลขลำดับของ PubChem เอง ทำไมเกลือจึงให้ SMILES ที่มีจุด? เกลือและของผสมมีองค์ประกอบแยกกัน ซึ่ง SMILES เขียนคั่นด้วยจุด เช่น [Na+].[Cl-]
ขั้นต่อไป: วาดด้วย SMILES เป็นโครงสร้าง หรือสร้างตัวระบุด้วย SMILES เป็น InChIKey
อัปเดตล่าสุด: