Convertitore da CID a SMILES

In breve: Converti ID di composti in stringhe SMILES canoniche per il lavoro in chimica. È gratuito, funziona nel browser e non richiede download.

Converti valori CID PubChem in identificatori SMILES canonici.

Lo SMILES generato compare qui.

Formati di input e output

Input: CID PubChemOutput: SMILES
Nome completoCID PubChemSMILES (Simplified Molecular Input Line Entry System)
Cosa contieneIl Compound ID di un record nel database PubChem. Viene cercato per ottenere la struttura.Atomi, legami, anelli, cariche e stereochimica in una sola riga di testo. Nessuna coordinata.
File o formaUn numero intero come 2244.smi o testo semplice

Formati di file spiegati

CID PubChem è un identificatore numerico di composti usato da PubChem. Punta a un record del database anziché codificare direttamente la struttura molecolare.

SMILES è una notazione lineare compatta della connettività molecolare. Convertire un CID in SMILES è utile quando un database fornisce un ID PubChem ma il tuo programma di disegno o di chemioinformatica richiede una stringa di struttura.

La ricerca per CID dipende dai record di PubChem. Record di composti diversi, sali, isotopi o forme stereochimiche possono avere CID e stringhe SMILES diversi.

Informazioni sui CID PubChem

Un PubChem Compound ID (CID) è l'identificatore numerico che PubChem assegna a ogni struttura chimica unica nel suo database. Per esempio, l'aspirina ha CID 2244 e la caffeina CID 2519. Articoli, cataloghi dei fornitori e dataset citano spesso i CID, ma un numero da solo non ti dice qual è la struttura. Convertirlo in SMILES ti dà una stringa di struttura modificabile.

Come si usa

  1. Inserisci un CID (solo cifre, senza il prefisso "CID").
  2. Avvia la conversione per ottenere lo SMILES canonico da PubChem.
  3. Copia lo SMILES in MolDraw, in un foglio di calcolo o in un altro convertitore.

FAQ

Un CID è uguale a un numero CAS? No. I numeri di registro CAS sono assegnati dal Chemical Abstracts Service e hanno un formato con trattini come 50-78-2; i CID sono numeri sequenziali propri di PubChem. Perché un sale dà uno SMILES con un punto? Sali e miscele contengono componenti separati, che lo SMILES scrive separati da un punto, per esempio [Na+].[Cl-].

Passi successivi: disegnalo con Da SMILES a struttura oppure ottieni un identificatore con Da SMILES a InChIKey.

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