Convertisseur CID en SMILES
En bref : obtenez les chaînes SMILES canoniques correspondant à des identifiants de composés pour vos flux de travail en chimie. C'est gratuit, cela fonctionne dans votre navigateur et ne nécessite aucun téléchargement.
Convertissez des CID PubChem en identifiants SMILES canoniques.
Formats d'entrée et de sortie
| Entrée : CID PubChem | Sortie : SMILES | |
|---|---|---|
| Nom complet | CID PubChem | SMILES (Simplified Molecular Input Line Entry System) |
| Contenu | L'identifiant (Compound ID) d'une fiche de la base de données PubChem. Il est recherché pour obtenir la structure. | Atomes, liaisons, cycles, charges et stéréochimie sur une seule ligne de texte. Pas de coordonnées. |
| Fichier ou forme | Un nombre entier comme 2244 | .smi ou texte brut |
Les formats de fichier expliqués
Le CID PubChem est un identifiant numérique de composé utilisé par PubChem. Il renvoie à une fiche de base de données au lieu de coder directement la structure moléculaire.
SMILES est une notation linéaire compacte de la connectivité moléculaire. Convertir un CID en SMILES est utile quand une base de données fournit un identifiant PubChem alors que votre outil de dessin ou de chémoinformatique attend une chaîne de structure.
La recherche par CID dépend des fiches PubChem. Des fiches de composés, sels, isotopes ou formes stéréochimiques différents peuvent avoir des CID et des chaînes SMILES différents.
À propos des CID PubChem
Un Compound ID (CID) PubChem est l'identifiant numérique que PubChem attribue à chaque structure chimique unique de sa base de données. Par exemple, l'aspirine a le CID 2244 et la caféine le CID 2519. Les articles, catalogues de fournisseurs et jeux de données citent souvent des CID, mais un nombre seul ne vous dit rien de la structure. Le convertir en SMILES vous donne une chaîne de structure modifiable.
Mode d'emploi
- Saisissez un CID (chiffres uniquement, sans le préfixe « CID »).
- Lancez la conversion pour récupérer le SMILES canonique depuis PubChem.
- Copiez le SMILES dans MolDraw, un tableur ou un autre convertisseur.
FAQ
Un CID est-il identique à un numéro CAS ? Non. Les numéros CAS (CAS Registry Numbers) sont attribués par le Chemical Abstracts Service et ont un format à tirets comme 50-78-2 ; les CID sont des numéros séquentiels propres à PubChem. Pourquoi un sel donne-t-il un SMILES avec un point ? Les sels et mélanges contiennent des composants séparés, que le SMILES écrit avec un point, par exemple [Na+].[Cl-].
Étapes suivantes : dessinez-le avec SMILES en structure ou obtenez un identifiant avec SMILES en InChIKey.
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