CID-in-SMILES-Konverter
Kurz gesagt: Löse Verbindungs-IDs in kanonische SMILES-Strings für Chemie-Workflows auf. Das Tool ist kostenlos, läuft im Webbrowser und braucht keinen Download.
Wandle PubChem-CIDs in kanonische SMILES um.
Eingabe- und Ausgabeformate
| Eingabe: PubChem CID | Ausgabe: SMILES | |
|---|---|---|
| Vollständiger Name | PubChem CID | SMILES (Simplified Molecular Input Line Entry System) |
| Inhalt | Die Compound ID eines Eintrags in der PubChem-Datenbank. Über sie wird die Struktur nachgeschlagen. | Atome, Bindungen, Ringe, Ladungen und Stereochemie als eine Textzeile. Keine Koordinaten. |
| Datei oder Form | Eine ganze Zahl wie 2244 | .smi oder Klartext |
Dateiformate erklärt
PubChem CID ist eine numerische Verbindungskennung von PubChem. Sie verweist auf einen Datenbankeintrag, statt die Molekülstruktur direkt zu kodieren.
SMILES ist eine kompakte Zeilennotation für die Verknüpfung von Molekülen. Die Umwandlung von CID in SMILES hilft, wenn eine Datenbank eine PubChem-ID liefert, dein Zeichen- oder Cheminformatik-Tool aber einen Struktur-String erwartet.
Die CID-Abfrage hängt von den PubChem-Einträgen ab. Verschiedene Verbindungseinträge, Salze, Isotope oder Stereoformen können unterschiedliche CIDs und SMILES-Strings haben.
Über PubChem-CIDs
Eine PubChem Compound ID (CID) ist die numerische Kennung, die PubChem jeder eindeutigen chemischen Struktur in seiner Datenbank zuweist. Zum Beispiel hat Aspirin die CID 2244 und Koffein die CID 2519. Paper, Lieferantenkataloge und Datensätze nennen oft CIDs, aber eine Zahl allein verrät nicht die Struktur. Die Umwandlung in SMILES liefert dir einen bearbeitbaren Struktur-String.
So funktioniert es
- Gib eine CID ein (nur Ziffern, ohne Präfix „CID“).
- Starte die Umwandlung, um den kanonischen SMILES von PubChem abzurufen.
- Kopiere den SMILES in MolDraw, eine Tabelle oder einen anderen Konverter.
FAQ
Ist eine CID dasselbe wie eine CAS-Nummer? Nein. CAS-Registriernummern vergibt der Chemical Abstracts Service im Format mit Bindestrichen wie 50-78-2; CIDs sind die fortlaufenden Nummern von PubChem. Warum ergibt ein Salz einen SMILES mit Punkt? Salze und Gemische bestehen aus getrennten Komponenten, die SMILES mit einem Punkt schreibt, zum Beispiel [Na+].[Cl-].
Nächste Schritte: Zeichne die Struktur mit SMILES in Struktur oder erzeuge eine Kennung mit SMILES in InChIKey.
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