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Convertidor químico por lotes (CSV de entrada, CSV de salida)
En resumen: convierte de una vez una lista completa de SMILES, nombres, números CAS, CID de PubChem, InChI o InChIKey. Obtén SMILES canónico, fórmula, peso molecular, masa exacta, InChI, InChIKey, nombre IUPAC, LogP, TPSA, donadores y aceptores de enlaces de hidrógeno y una comprobación de Lipinski, y descarga CSV, TSV o SDF. Es gratuito, funciona en tu navegador y no requiere descargas.
Pega un identificador por línea o abre un archivo CSV, TSV o TXT. Los SMILES se procesan en tu dispositivo, hasta 5000 filas por ejecución. Los nombres, números CAS y otros identificadores se consultan primero en PubChem; esas filas se marcan como online.
CC(=O)Oc1ccccc1C(=O)O, da C9H8O4, PM 180,159 g/mol, masa exacta 180,0423, TPSA 63,6 Ų, 1 donador, 4 aceptores y un Cumple de Lipinski. Después pulsa Descargar CSV.Salidas
Listo.
Cómo convertir una lista de sustancias químicas
- Pega tu lista o pulsa Abrir CSV / TSV / TXT. Sirve un valor por línea, y también una hoja de cálculo guardada como CSV.
- Revisa la línea bajo el cuadro. Indica cuántas filas y columnas se han leído y qué separador se ha encontrado.
- Para una tabla, elige la Columna del identificador y marca La primera fila es un encabezado si la fila 1 contiene los nombres de las columnas.
- Deja Tipo de entrada en Detectar en cada fila, o fuerza SMILES, Nombre, Número CAS, CID de PubChem, InChI o InChIKey.
- Marca las Salidas que necesites. Las salidas marcadas como online requieren una consulta por internet.
- Pulsa Convertir. La barra de progreso muestra las filas completadas, los errores y las consultas en línea. Pulsa Detener para terminar antes y conservar lo ya hecho.
- Revisa la vista previa y pulsa Descargar CSV, Descargar TSV o Descargar SDF.
Entradas y salidas
| Entrada | Ejemplo | Cómo se lee |
|---|---|---|
| SMILES | CN1C=NC2=C1C(=O)N(C(=O)N2C)C | En tu dispositivo |
| Nombre (común o IUPAC) | cafeína | En línea, PubChem |
| Número de registro CAS | 58-08-2 | Se comprueba el dígito de control y luego PubChem |
| CID de PubChem | 2519 | En línea, PubChem |
| InChI | InChI=1S/C8H10N4O2/… | En línea, PubChem |
| InChIKey | RYYVLZVUVIJVGH-UHFFFAOYSA-N | En línea, PubChem |
Qué significa cada salida
| Salida | Significado | Origen |
|---|---|---|
| SMILES canónico | Un SMILES estándar por estructura, para que los duplicados coincidan | Local |
| Fórmula molecular | Orden de Hill (C, H y luego A–Z), con la carga neta añadida | Local |
| MW (g/mol) | Masa molar media a partir de los pesos atómicos estándar | Local |
| Masa exacta | Masa monoisotópica (isótopo más abundante de cada elemento), para espectrometría de masas | Local |
| InChI, InChIKey | Identificadores estándar de la IUPAC para búsquedas en bases de datos | En línea |
| Nombre IUPAC | Nombre sistemático de PubChem, si el compuesto está registrado | En línea |
| cLogP | Coeficiente de reparto octanol-agua calculado | Local |
| TPSA (Ų) | Área de superficie polar topológica a partir de las contribuciones de N y O | Local |
| HBD, HBA | Donadores (N–H, O–H) y aceptores (átomos de N y O) de enlaces de hidrógeno | Local |
| Lipinski | Cumple si se supera como máximo un límite de la regla de los cinco | Local |
Ejemplos resueltos
Aspirina a partir de SMILES
CC(=O)Oc1ccccc1C(=O)O
C9H8O4, masa exacta 180,0423, TPSA 63,6 Ų, HBD 1, HBA 4.
PM 180,159 g/mol, Lipinski: cumple
Cafeína a partir de su número CAS
58-08-2 supera la comprobación del dígito de control y se consulta en línea.
C8H10N4O2, TPSA 58,4 Ų, HBD 0.
PM 194,19 g/mol, InChIKey RYYVLZVUVIJVGH-UHFFFAOYSA-N
Una hoja de cálculo con ID
Columnas id;smiles;IC50 separadas por punto y coma.
El separador y la columna de SMILES se detectan automáticamente.
Tus columnas id e IC50 se conservan junto a los resultados
Atorvastatina
PM 558,6 g/mol y cLogP superior a 5.
Se superan dos límites de la regla de los cinco.
Lipinski: no cumple (PM > 500; LogP > 5)
Errores comunes
- Nombres en una columna de SMILES. Con Tipo de entrada en SMILES, «aspirin» falla. Usa Detectar en cada fila para listas mixtas.
- Excel ha cambiado tus números CAS. Las hojas de cálculo pueden convertir 7732-18-5 en una fecha. Da formato de texto a la columna antes de guardar.
- Sales y mezclas. Un SMILES con un punto, como
[Na+].[Cl-], se trata como una sola entrada. El PM y la fórmula incluyen todas las partes. - Encabezado leído como datos. Si la fila 1 contiene los nombres de las columnas, marca La primera fila es un encabezado; si no, aparecerá como fila fallida.
- Comparar valores de LogP de métodos distintos. cLogP y XLogP3 son estimaciones. Usa un solo método para toda una serie.
- Listas de nombres muy largas. Las consultas en línea van a unas cuatro por segundo. Convierte los nombres a SMILES una vez y trabaja después con el archivo de SMILES.
¿Quieres ver una estructura? Pega cualquier SMILES en MolDraw, un editor de estructuras químicas gratuito en línea, para dibujarla, editarla y exportarla en PNG, SVG o MOL.
Abrir el editor MolDrawPreguntas frecuentes
¿Cómo convierto una lista de SMILES en pesos moleculares de una vez?
Pega los SMILES uno por línea, o abre un archivo CSV y elige la columna de SMILES. Deja marcada la opción MW (g/mol) y pulsa Convertir. Cuando termine, pulsa Descargar CSV. Los SMILES se procesan en tu dispositivo, así que hasta 5000 filas tardan solo unos segundos.
¿Qué entradas requieren una consulta por internet?
Los SMILES se leen en tu dispositivo. Los nombres, números CAS, CID de PubChem, InChI e InChIKey se consultan primero en la base de datos gratuita PubChem para obtener la estructura. Las salidas InChI, InChIKey y nombre IUPAC también se consultan en línea. Las filas en línea aparecen marcadas como online en la vista previa y se limitan a unas cuatro por segundo.
¿Puedo subir un CSV con varias columnas?
Sí. El convertidor detecta separadores de coma, tabulador, punto y coma y barra vertical, celdas entre comillas y la marca de orden de bytes. Deduce la fila de encabezado y la columna del identificador, y puedes cambiar ambas. Marca Conservar mis otras columnas para copiar tus ID o valores de actividad en la salida.
¿Qué significa la columna de Lipinski?
La regla de los cinco de Lipinski señala una mala absorción oral cuando un compuesto incumple más de uno de estos criterios: PM ≤ 500, LogP ≤ 5, como máximo 5 donadores de enlaces de hidrógeno y como máximo 10 aceptores. Cumple significa ninguna o una infracción. La columna de infracciones indica qué límites se han superado.
¿Por qué mi LogP difiere del XLogP3 de PubChem?
Hay varias formas de estimar el LogP. Este convertidor usa un cLogP calculado a partir de contribuciones atómicas, mientras que PubChem da el XLogP3. Ambos suelen coincidir con una diferencia de una unidad aproximadamente. Compara compuestos con el mismo método.
¿Qué contiene la descarga SDF?
Un registro por fila convertida: una estructura 2D con coordenadas, la entrada como línea de título y cada salida elegida (fórmula, PM, LogP, etc.) como campo de datos SDF. La mayoría de los programas y bases de datos químicas pueden abrirlo.
¿Por qué ha fallado una fila?
La columna Estado indica el motivo: por ejemplo, un SMILES con un anillo o un corchete sin cerrar, un número CAS con un dígito de control incorrecto o un nombre que PubChem no conoce. Corrige la entrada y vuelve a ejecutar el convertidor. Las demás filas no se ven afectadas.
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