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點群判定工具(分子對稱性)

簡而言之:輸入 SMILES 或選擇經典分子,即可取得點群、對稱元素、階數、掌性、極性與特徵標表,每條軸與每個鏡面都以 3D 繪出。完全免費,在網頁瀏覽器中執行,不需下載。

工具會建立分子的 3D 形狀,找出所有旋轉軸、鏡面、反轉中心與非真旋轉軸,並以熊夫利符號命名點群。

快速解答:水(H2O)屬於 C2v:E、一條 C2 軸與兩個 σv 鏡面,階數 4。氨為 C3v,甲烷為 Td,BF3 為 D3h,SF6 為 Oh,苯為 D6h,CO2 為 D∞h。

如何使用點群判定工具

  1. 按下 H2O 或 BF3 等範例按鈕,從清單中選擇任一分子,或輸入 SMILES 字串,例如 O、c1ccccc1 或 Cl/C=C/Cl。
  2. 查看點群、階數,以及分子是否具掌性與極性。
  3. 旋轉 3D 模型。旋轉軸、鏡面、反轉中心與 Sn 軸會以彩色繪出。將游標移到清單中的元素上即可將其標亮。
  4. 依照通往該點群的是/否步驟,並閱讀其特徵標表。

對於 SMILES,MolDraw 的結構引擎會補上氫原子,建立數個 3D 形狀並加以最佳化,保留能量最低者。柔性分子以該形狀判定(乙烷會是交錯式)。範例庫分子使用理想的精確幾何。在容許誤差內的微小變形會被平均掉。

對稱元素與對稱操作

對稱操作是移動分子後使其看起來完全相同的操作。對稱元素是該操作所依據的點、線或面。一個元素可產生數個操作:一條 C3 軸可產生 C3 與 C32。

符號對稱元素對稱操作範例
E恆等不做任何動作。所有分子都有。所有分子
Cn真旋轉軸旋轉 360°/n。n 最大的軸為主軸。H2O 中的 C2、NH3 中的 C3、苯中的 C6
σ鏡面對鏡面反射。σh 與主軸垂直;σv 與 σd 包含主軸。BF3 中的 σh、NH3 中的 σv、丙二烯中的 σd
i反轉中心將每個原子經過中心移到對面。SF6、CO2、反-1,2-二氯乙烯
Sn非真旋轉軸旋轉 360°/n,再對垂直的平面反射。S1 = σ,S2 = i。CH4 與丙二烯中的 S4、交錯式乙烷中的 S6

點群判定流程圖

  1. 分子是否為直線形?是:有反轉中心者為 D∞h(CO2、H–C≡C–H);沒有者為 C∞v(HCl、HCN)。
  2. 是否有多條 n ≥ 3 的軸?是:屬於高對稱群。四條 C3 軸且無 C4:四面體,Td(CH4)。三條 C4 軸:八面體,Oh(SF6)。六條 C5 軸:二十面體,Ih(C60)。若沒有鏡面,則分別為 T、O 或 I。
  3. 是否有任何旋轉軸 Cn?否:有鏡面為 Cs,有反轉中心為 Ci,都沒有為 C1。
  4. 找出主軸 Cn。是否有 n 條與它垂直的 C2 軸?
  5. 是(D 群):有 σh → Dnh;否則有 n 個 σd 鏡面 → Dnd;否則為 Dn。
  6. 否(C 與 S 群):有 σh → Cnh;否則有 n 個 σv 鏡面 → Cnv;否則有 S2n 軸 → S2n;否則為 Cn。

工具會在「點群判定過程」下顯示每個分子所經過的路徑。

常見點群一覽

點群對稱元素階數範例
C1E1CHFClBr
CsE, σ2HOCl、CH3OH
C2E, C22H2O2
C2vE, C2, 2σv4H2O、SO2、CH2Cl2、順-1,2-二氯乙烯
C3vE, C3, 3σv6NH3、CHCl3、PCl3
C2hE, C2, σh, i4反-1,2-二氯乙烯、反式 N2F2
D2hE, 3C2, 3σ, i8乙烯、萘、乙硼烷
D3hE, C3, 3C2, σh, S3, 3σv12BF3、PCl5、重疊式乙烷、環丙烷
D4hE, C4, 4C2, σh, 4σ, i, S416XeF4、[PtCl4]2−
D6hE, C6, 6C2, σh, 6σ, i, S6, S324苯
D2dE, S4, 3C2, 2σd8丙二烯
D3dE, C3, 3C2, 3σd, i, S612交錯式乙烷、椅式環己烷
TdE, 4C3, 3C2, 3S4, 6σd24CH4、CCl4、P4
OhE, 3C4, 4C3, 6C2, 9σ, i, S4, S648SF6、立方烷
C∞vE, C∞, ∞σv∞HCl、HCN、OCS
D∞hE, C∞, ∞C2, ∞σv, σh, i∞CO2、H2、乙炔

掌性、極性與特徵標表

掌性

分子沒有非真旋轉軸時即具掌性:沒有鏡面、沒有反轉中心,也沒有 Sn。只有 C1、Cn、Dn、T、O 與 I 群符合。CHFClBr(C1)與 H2O2(C2)具掌性。只有 S4 軸的分子即使沒有鏡面也不具掌性。要為立體中心標定 R 與 S,請使用 R/S 掌性判定工具。

極性

偶極矩在每個操作後都必須指向同一方向,這只有在 C1、Cs、Cn 與 Cnv(包括 C∞v)中才可能。水(C2v)與氨(C3v)是極性分子;CO2、BF3、CH4、SF6 與反-1,2-二氯乙烯則不是。

如何閱讀特徵標表

每一欄是一類操作,例如 2C3(C3 與 C32 旋轉)。每一列是一個不可約表示,其特徵標顯示軌域或振動在各操作下的行為:1 表示不變,−1 表示變號。Mulliken 符號:A 與 B 為一維(A 對主軸對稱,B 則否),E 為二維,T 為三維;g 與 u 表示對反轉對稱或反對稱;′ 與 ″ 表示對 σh 對稱或反對稱。最後兩欄列出 x、y、z、旋轉 Rx、Ry、Rz 以及二次函數(x2、xy 等)所屬的表示,由此可判斷哪些振動具 IR 活性(x、y、z)與拉曼活性(二次函數)。

範例解析

水,H2O

彎曲形,非直線形。一條通過 O 的 C2 軸。沒有垂直的 C2,沒有 σh,但有兩個 σv 鏡面。

C2v,階數 4,極性,不具掌性

氨,NH3

通過 N 的 C3 軸。沒有垂直的 C2,沒有 σh,有三個 σv 鏡面,各通過一個 N–H 鍵。

C3v,階數 6,極性

三氟化硼,BF3

一條 C3 軸、三條沿 B–F 鍵的 C2 軸,分子平面即為 σh。

D3h,階數 12,非極性

甲烷,CH4

四條 C3 軸(各沿一個 C–H 鍵)、三條 S4 軸、六個 σd 鏡面,沒有反轉中心。

Td,階數 24,非極性

反-與順-1,2-二氯乙烯

反式:C2 垂直於分子平面,分子平面為 σh,另有 i。順式:C2 位於平面內,並有兩個 σv。

反式 C2h(非極性);順式 C2v(極性)

乙烷:交錯式與重疊式

兩者都有一條 C3 軸與三條垂直的 C2 軸。交錯式有 i 與三個 σd;重疊式有 σh。

交錯式 D3d;重疊式 D3h

丙二烯,H2C=C=CH2

兩個 CH2 平面互成 90°。主軸為 S4(含 C2),另有兩條垂直的 C2 軸與兩個 σd。

D2d,階數 8

CHFClBr

碳周圍有四個不同原子。沒有軸、沒有鏡面、沒有反轉中心。

C1,具掌性且為極性

常見錯誤

想探索更大的分子嗎?在 MolDraw 編輯器中畫出分子,開啟「對稱性」面板,即可以 3D 播放每個對稱操作。

開啟 MolDraw 編輯器

常見問題

水的點群是什麼?

水屬於 C2v。它具有恆等操作 E、一條通過氧的 C2 軸,以及兩個垂直鏡面(其中一個是分子平面)。此點群有 4 個操作,因此階數為 4。

如何判定分子的點群?

使用流程圖。分子是否為直線形?是否有多條高階軸(Td、Oh、Ih)?若否,找出最高階的旋轉軸 Cn。檢查是否有 n 條與它垂直的 C2 軸(D 群),再看是否有水平鏡面(Dnh 或 Cnh),然後看是否有垂直或二面鏡面(Cnv 或 Dnd)。若完全沒有旋轉軸,則找鏡面(Cs)或反轉中心(Ci),都沒有則為 C1。

σv 與 σd 有什麼不同?

兩者都是包含主軸的鏡面。二面鏡面(σd)平分兩條與主軸垂直的 C2 軸之間的夾角,或位於兩個 σv 鏡面之間。包含這些 C2 軸的鏡面,或在 Cnv 分子中包含外圍原子的鏡面,則標為 σv。

如何由對稱性判斷分子是否具掌性?

分子沒有非真旋轉軸時即具掌性:沒有鏡面、沒有反轉中心,也沒有 Sn 軸。因此只有 C1、Cn、Dn、T、O 與 I 群的分子可能具掌性。CHFClBr(C1)與 H2O2(C2)具掌性;水(C2v)則否。

哪些點群可以有偶極矩?

只有 C1、Cs、Cn 與 Cnv 的分子(包括直線形的 C∞v 群)可以是極性分子。其他點群中,對稱操作會抵消任何偶極。因此水(C2v)與氨(C3v)是極性分子,而 CO2(D∞h)、BF3(D3h)與 CH4(Td)則不是。

點群的階數是什麼意思?

階數是群中對稱操作的數目,包括恆等操作。C2v 的階數為 4(E、C2、σv、σv′),C3v 為 6,Td 為 24,Oh 為 48。直線形分子的點群階數為無限大。

為什麼交錯式與重疊式乙烷的點群不同?

點群描述的是 3D 形狀。交錯式乙烷有反轉中心與二面鏡面,因此是 D3d。重疊式乙烷則有水平鏡面,因此是 D3h。輸入 SMILES 時,工具會建立能量最低的形狀,乙烷即為交錯式。

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