点群判断工具(分子对称性)
简而言之:输入 SMILES 或选择一个经典分子,即可得到点群、对称元素、阶、手性、极性和特征标表,每根轴和每个镜面都以 3D 方式绘出。免费使用,在网页浏览器中运行,无需下载。
工具会构建分子的 3D 形状,找出所有旋转轴、镜面、对称中心和非真轴,并用 Schoenflies 符号给出点群名称。
拖动可旋转,双指捏合或滚动可缩放。颜色:C2 青绿色、C3 琥珀色、C4 紫色、C5 玫红色、C6 蓝色;σh 绿色、σv 靛蓝色、σd 粉色;对称中心橙色。
如何使用点群判断工具
- 点击 H2O 或 BF3 等示例按钮,从列表中选择任一分子,或输入 SMILES 字符串,例如
O、c1ccccc1或Cl/C=C/Cl。 - 查看点群、它的阶,以及分子是否有手性、是否有极性。
- 旋转 3D 模型。轴、镜面、对称中心和 Sn 轴都用彩色绘出。将鼠标悬停在列表中的某个元素上即可高亮显示。
- 按照得出该点群的“是/否”步骤逐步查看,并阅读它的特征标表。
对于 SMILES,MolDraw 的结构引擎会补上氢原子,构建多个 3D 构象并进行优化,保留能量最低的一个。柔性分子按该构象判断(乙烷得到交叉式)。示例库中的分子使用理想的精确几何构型。容差范围内的微小畸变会被平均掉。
对称元素与对称操作
对称操作使分子移动后看起来与原来完全一样。对称元素是该操作所依据的点、线或面。一个元素可以产生多个操作:一根 C3 轴产生 C3 和 C32。
| 符号 | 对称元素 | 对称操作 | 示例 |
|---|---|---|---|
| E | 恒等元素 | 不做任何操作。每个分子都有。 | 所有分子 |
| Cn | 真旋转轴 | 旋转 360°/n。n 最大的轴为主轴。 | H2O 中的 C2,NH3 中的 C3,苯中的 C6 |
| σ | 镜面 | 通过镜面反映。σh 垂直于主轴;σv 和 σd 包含主轴。 | BF3 中的 σh,NH3 中的 σv,丙二烯中的 σd |
| i | 对称中心 | 把每个原子经过中心送到相反的一侧。 | SF6、CO2、反-1,2-二氯乙烯 |
| Sn | 非真旋转轴(映转轴) | 旋转 360°/n,再通过与之垂直的平面反映。S1 = σ,S2 = i。 | CH4 和丙二烯中的 S4,交叉式乙烷中的 S6 |
点群判断流程图
- 分子是线形的吗?是:有对称中心则为 D∞h(CO2、H–C≡C–H);没有则为 C∞v(HCl、HCN)。
- 有多根 n ≥ 3 的轴吗?是:属于高对称性点群。四根 C3 轴且无 C4:四面体,Td(CH4)。三根 C4 轴:八面体,Oh(SF6)。六根 C5 轴:二十面体,Ih(C60)。没有镜面时则分别为 T、O 或 I。
- 有旋转轴 Cn 吗?没有:有镜面为 Cs,有对称中心为 Ci,都没有则为 C1。
- 找出主轴 Cn。是否有 n 根与之垂直的 C2 轴?
- 有(D 群):有 σh → Dnh;否则有 n 个 σd 面 → Dnd;否则为 Dn。
- 没有(C 群和 S 群):有 σh → Cnh;否则有 n 个 σv 面 → Cnv;否则有 S2n 轴 → S2n;否则为 Cn。
对于每个分子,工具会在“点群判断过程”下显示它所走的路径。
常见点群一览
| 点群 | 对称元素 | 阶 | 示例 |
|---|---|---|---|
| C1 | E | 1 | CHFClBr |
| Cs | E, σ | 2 | HOCl, CH3OH |
| C2 | E, C2 | 2 | H2O2 |
| C2v | E, C2, 2σv | 4 | H2O、SO2、CH2Cl2、顺-1,2-二氯乙烯 |
| C3v | E, C3, 3σv | 6 | NH3、CHCl3、PCl3 |
| C2h | E, C2, σh, i | 4 | 反-1,2-二氯乙烯、反-N2F2 |
| D2h | E, 3C2, 3σ, i | 8 | 乙烯、萘、乙硼烷 |
| D3h | E, C3, 3C2, σh, S3, 3σv | 12 | BF3、PCl5、重叠式乙烷、环丙烷 |
| D4h | E, C4, 4C2, σh, 4σ, i, S4 | 16 | XeF4、[PtCl4]2− |
| D6h | E, C6, 6C2, σh, 6σ, i, S6, S3 | 24 | 苯 |
| D2d | E, S4, 3C2, 2σd | 8 | 丙二烯 |
| D3d | E, C3, 3C2, 3σd, i, S6 | 12 | 交叉式乙烷、椅式环己烷 |
| Td | E, 4C3, 3C2, 3S4, 6σd | 24 | CH4、CCl4、P4 |
| Oh | E, 3C4, 4C3, 6C2, 9σ, i, S4, S6 | 48 | SF6、立方烷 |
| C∞v | E, C∞, ∞σv | ∞ | HCl、HCN、OCS |
| D∞h | E, C∞, ∞C2, ∞σv, σh, i | ∞ | CO2、H2、乙炔 |
手性、极性与特征标表
手性
分子没有非真轴时就是手性的:没有镜面、没有对称中心、也没有 Sn。只有 C1、Cn、Dn、T、O 和 I 群符合。CHFClBr(C1)和 H2O2(C2)有手性。只有 S4 轴的分子即使没有镜面也没有手性。要为手性中心标定 R 和 S,请使用 R/S 手性判断工具。
极性
偶极矩在每个对称操作后都必须指向同一方向。这只在 C1、Cs、Cn 和 Cnv(包括 C∞v)中才可能。水(C2v)和氨(C3v)是极性分子;CO2、BF3、CH4、SF6 和反-1,2-二氯乙烯不是。
如何阅读特征标表
每一列是一类操作,例如 2C3(C3 和 C32 两个旋转)。每一行是一个不可约表示。它的特征标表示轨道或振动在每个操作下的行为:1 表示不变,−1 表示变号。Mulliken 符号:A 和 B 是一维的(A 对主轴对称,B 不对称),E 是二维的,T 是三维的;g 和 u 表示对反演对称或反对称;′ 和 ″ 表示对 σh 对称或反对称。最后两列列出 x、y、z、转动 Rx、Ry、Rz 以及二次函数(x2、xy 等)所属的表示。这两列告诉你哪些振动是红外活性的(x、y、z),哪些是拉曼活性的(二次函数)。
例题
水,H2O
角形,不是线形。一根穿过 O 的 C2 轴。没有与之垂直的 C2,没有 σh,但有两个 σv 面。
C2v,阶为 4,极性,无手性
氨,NH3
一根穿过 N 的 C3 轴。没有垂直的 C2,没有 σh,有三个 σv 面,每个都穿过一根 N–H 键。
C3v,阶为 6,极性
三氟化硼,BF3
一根 C3 轴,三根沿 B–F 键的 C2 轴,分子平面是 σh。
D3h,阶为 12,非极性
甲烷,CH4
四根 C3 轴(每根沿一根 C–H 键),三根 S4 轴,六个 σd 面,没有对称中心。
Td,阶为 24,非极性
反式和顺式 1,2-二氯乙烯
反式:一根垂直于分子平面的 C2,分子平面是 σh,另有 i。顺式:一根在分子平面内的 C2 和两个 σv。
反式 C2h(非极性);顺式 C2v(极性)
乙烷:交叉式与重叠式
两者都有一根 C3 轴和三根与之垂直的 C2 轴。交叉式有 i 和三个 σd;重叠式有 σh。
交叉式 D3d;重叠式 D3h
丙二烯,H2C=C=CH2
两个 CH2 平面互成 90°。主轴是 S4(同时是 C2),有两根垂直的 C2 轴和两个 σd。
D2d,阶为 8
CHFClBr
碳原子周围连有四个不同的原子。没有轴、没有镜面、没有对称中心。
C1,有手性,有极性
常见错误
- 根据平面结构式判断。点群需要 3D 形状。椅式环己烷是 D3d,而不是 D6h;交叉式和重叠式乙烷也不同。
- 漏掉 Sn 轴。CH4 和丙二烯都有 S4 轴。漏掉它们就会选错点群。
- 混淆 σv 和 σd。在 D 群中,平分两根垂直 C2 轴的镜面是 σd。
- 选错主轴。主轴是 n 最大的轴。在 XeF4 中,主轴是垂直于分子平面的 C4 轴,而不是平面内的 C2。
- 数对称元素而不是对称操作。阶数的是操作:一根 C3 轴产生两个操作(C3 和 C32)。
- 以为孤对电子会增加对称性。只有原子位置才算数,但孤对电子会影响几何构型。NH3 是三角锥形(C3v),不是平面形。
想研究更大的分子?在 MolDraw 编辑器中画出它,打开“对称性”面板,即可在 3D 中逐一演示每个操作。
打开 MolDraw 编辑器常见问题
水分子属于什么点群?
水属于 C2v 点群。它有恒等操作 E、一根穿过氧原子的 C2 轴和两个竖直镜面(其中一个是分子平面)。该群有 4 个操作,因此阶为 4。
如何确定分子的点群?
按流程图判断。分子是线形的吗?是否有多根高次轴(Td、Oh、Ih)?如果没有,找出最高次旋转轴 Cn。检查是否有 n 根与之垂直的 C2 轴(D 群),再看是否有水平镜面(Dnh 或 Cnh),然后看是否有竖直镜面或双面镜面(Cnv 或 Dnd)。若没有任何旋转轴,则看是否有镜面(Cs)或对称中心(Ci),否则为 C1。
σv 和 σd 有什么区别?
两者都是包含主轴的镜面。双面镜面(σd)平分两根垂直于主轴的 C2 轴之间的夹角,或位于两个 σv 面之间。包含这些 C2 轴的镜面,或 Cnv 分子中包含外围原子的镜面,记为 σv。
如何通过对称性判断分子是否有手性?
分子没有非真轴时就是手性的:没有镜面、没有对称中心、也没有 Sn 轴。因此只有 C1、Cn、Dn、T、O 和 I 群中的分子才可能有手性。CHFClBr(C1)和 H2O2(C2)有手性;水(C2v)没有。
哪些点群的分子可以有偶极矩?
只有 C1、Cs、Cn 和 Cnv(包括线形的 C∞v 群)的分子可以是极性的。在其他所有点群中,对称操作会抵消任何偶极。因此水(C2v)和氨(C3v)是极性分子,而 CO2(D∞h)、BF3(D3h)和 CH4(Td)不是。
点群的阶是什么意思?
阶是群中对称操作的数目,包括恒等操作。C2v 的阶为 4(E、C2、σv、σv′),C3v 的阶为 6,Td 为 24,Oh 为 48。线形分子的点群阶为无穷大。
为什么交叉式和重叠式乙烷属于不同的点群?
点群描述的是 3D 形状。交叉式乙烷有对称中心和双面镜面,属于 D3d。重叠式乙烷则有水平镜面,属于 D3h。输入 SMILES 时,工具会构建能量最低的构象,乙烷的能量最低构象是交叉式。
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