Konwerter SMILES na InChI
W skrócie: Przekształcaj ciągi SMILES w standardowe identyfikatory InChI do baz danych i publikacji. Jest darmowy, działa w przeglądarce i nie wymaga pobierania.
Konwertuj SMILES na standardowy InChI do wyszukiwania, indeksowania i publikacji.
Formaty wejściowe i wyjściowe
| Dane wejściowe: SMILES | Wynik: InChI | |
|---|---|---|
| Pełna nazwa | SMILES (Simplified Molecular Input Line Entry System) | InChI (IUPAC International Chemical Identifier) |
| Co zawiera | Atomy, wiązania, pierścienie, ładunki i stereochemię w jednym wierszu tekstu. Bez współrzędnych. | Warstwowy identyfikator tekstowy tworzony na podstawie struktury. Standardowy InChI jest taki sam w każdym programie. |
| Plik lub forma | .smi lub zwykły tekst | Tekst zaczynający się od InChI=1S/ |
Formaty plików w skrócie
SMILES to zwarta notacja liniowa opisująca połączenia w cząsteczce. Jest wygodna w narzędziach do rysowania, polach wyszukiwania i skryptach.
InChI to Międzynarodowy Identyfikator Chemiczny IUPAC (International Chemical Identifier). Jest to warstwowy, ustandaryzowany identyfikator przeznaczony do wymiany, indeksowania i porównywania danych w chemicznych bazach danych.
Używaj SMILES, gdy potrzebujesz edytowalnego ciągu opisującego strukturę. Używaj InChI, gdy potrzebujesz ustandaryzowanego identyfikatora, mniej zależnego od konkretnego stylu kanonizacji SMILES.
Przykład i odczytywanie wyniku
SMILES aspiryny CC(=O)OC1=CC=CC=C1C(=O)O przekształca się w:
InChI=1S/C9H8O4/c1-6(10)13-8-5-3-2-4-7(8)9(11)12/h2-5H,1H3,(H,11,12)
1S: wersja 1, standardowy InChI.C9H8O4: warstwa wzoru sumarycznego./c…: warstwa połączeń, z własną numeracją atomów InChI./h…: położenie atomów wodoru; nawiasy oznaczają ruchomy wodór współdzielony przez dwa atomy tlenu grupy karboksylowej.
Dlaczego ta sama cząsteczka zawsze daje ten sam InChI
Aspirynę może opisywać kilka różnych SMILES, zależnie od atomu początkowego. Standardowy InChI jest kanoniczny, więc wszystkie dają identyczny ciąg jak powyżej. Dzięki temu InChI dobrze sprawdza się przy porównywaniu struktur i wykrywaniu duplikatów.
FAQ
Czy uwzględniana jest stereochemia? Tak. @ i @@ w SMILES stają się warstwami /t, /m i /s w InChI. Potrzebujesz czegoś krótszego? Użyj konwertera SMILES na InChIKey.
Ostatnia aktualizacja: