SMILES’tan InChI’ye Dönüştürücü
Kısaca: Veritabanı ve yayın çalışmaları için SMILES dizelerini standart InChI tanımlayıcılarına dönüştürün. Ücretsizdir, web tarayıcınızda çalışır ve indirme gerektirmez.
Arama, dizinleme ve yayın çalışmaları için SMILES’ı standart InChI’ye dönüştürün.
Girdi ve çıktı biçimleri
| Girdi: SMILES | Çıktı: InChI | |
|---|---|---|
| Tam adı | SMILES (Simplified Molecular Input Line Entry System) | InChI (IUPAC International Chemical Identifier) |
| Ne içerir | Atomlar, bağlar, halkalar, yükler ve stereokimya tek satırlık metin olarak. Koordinat yok. | Yapıdan oluşturulan katmanlı bir metin tanımlayıcısı. Standart InChI her programda aynıdır. |
| Dosya veya biçim | .smi veya düz metin | InChI=1S/ ile başlayan metin |
Dosya biçimi açıklaması
SMILES, moleküler bağlantılar için kompakt bir satır gösterimidir. Çizim araçları, arama kutuları ve betikler için kullanışlıdır.
InChI, IUPAC Uluslararası Kimyasal Tanımlayıcısıdır. Kimyasal veritabanı alışverişi, dizinleme ve karşılaştırma için tasarlanmış katmanlı, standartlaştırılmış bir tanımlayıcıdır.
Düzenlenebilir bir yapı dizesine ihtiyacınız olduğunda SMILES kullanın. Belirli bir SMILES kanonikleştirme tarzına daha az bağımlı, standartlaştırılmış bir tanımlayıcıya ihtiyacınız olduğunda InChI kullanın.
Örnek ve çıktıyı okuma
Aspirinin SMILES’ı CC(=O)OC1=CC=CC=C1C(=O)O şuna dönüşür:
InChI=1S/C9H8O4/c1-6(10)13-8-5-3-2-4-7(8)9(11)12/h2-5H,1H3,(H,11,12)
1S: sürüm 1, standart InChI.C9H8O4: molekül formülü katmanı./c…: InChI’nin kendi atom numaralandırmasını kullanan bağlantı katmanı./h…: hidrojenlerin konumu; parantezler iki karboksilik asit oksijeni arasında paylaşılan hareketli bir hidrojeni gösterir.
Aynı molekül neden her zaman aynı InChI’yi verir
Hangi atomdan başladığınıza bağlı olarak aspirini birkaç farklı SMILES tanımlayabilir. Standart InChI kanoniktir, bu yüzden hepsi yukarıdaki aynı dizeyi üretir. Bu, InChI’yi yapıları karşılaştırmak ve yinelenenleri kontrol etmek için iyi bir seçim yapar.
SSS
Stereokimya dahil mi? Evet. SMILES’taki @ ve @@, InChI’de /t, /m ve /s katmanlarına dönüşür. Daha kısa bir şey mi gerekiyor? SMILES’tan InChIKey’e aracını kullanın.
Son güncelleme: