Konwerter SMILES na InChIKey
W skrócie: Przekształcaj ciągi SMILES w łatwe do wyszukania identyfikatory InChIKey. Jest darmowy, działa w przeglądarce i nie wymaga pobierania.
Generuj zwarte identyfikatory InChIKey z ciągów SMILES.
Formaty wejściowe i wyjściowe
| Dane wejściowe: SMILES | Wynik: InChIKey | |
|---|---|---|
| Pełna nazwa | SMILES (Simplified Molecular Input Line Entry System) | InChIKey |
| Co zawiera | Atomy, wiązania, pierścienie, ładunki i stereochemię w jednym wierszu tekstu. Bez współrzędnych. | 27-znakowy skrót (hash) InChI, stworzony do wyszukiwania w sieci i bazach danych. Bez bazy do wyszukiwania nie da się go z powrotem zamienić na strukturę. |
| Plik lub forma | .smi lub zwykły tekst | Tekst w postaci XXXXXXXXXXXXXX-YYYYYYYYYY-Z |
Formaty plików w skrócie
SMILES to zwarta notacja tekstowa struktury cząsteczki. Przydaje się do wprowadzania, edycji i konwersji.
InChIKey to haszowany identyfikator o stałej długości wyprowadzony z InChI. Służy do szybkiego dopasowywania w bazach danych i wyszukiwania w internecie, ale nie da się go w pełni odwrócić bez wyszukania w bazie.
Używaj InChIKey, gdy potrzebujesz stałego klucza wyszukiwania dla związku; używaj SMILES, gdy potrzebujesz edytowalnego ciągu opisującego strukturę.
Dlaczego warto używać InChIKey
InChIKey zaprojektowano do wyszukiwania. Wklejenie pełnego InChI lub SMILES do wyszukiwarki często zawodzi, bo symbole takie jak =, / i nawiasy są traktowane specjalnie. 27-znakowy klucz złożony tylko z liter i łączników wyszukuje się bez problemu i niezawodnie dopasowuje do rekordów w bazach danych.
Przykład
Kofeina, CN1C=NC2=C1C(=O)N(C(=O)N2C)C, daje InChIKey RYYVLZVUVIJVGH-UHFFFAOYSA-N. Wyszukanie tego klucza zwraca strony kofeiny w PubChem, ChEMBL i innych bazach danych.
Budowa klucza
- Pierwsze 14 znaków: skrót (hash) połączeń.
- Kolejne 10 znaków: skrót warstw stereochemii i izotopów oraz flagi wersji.
UHFFFAOYSApojawia się dla struktur bez warstw stereo i izotopowych. - Ostatni znak: protonowanie (N = obojętny).
FAQ
Czy enancjomery mają różne klucze? Tak, jeśli stereochemia jest zdefiniowana w SMILES. Mają wspólny pierwszy blok i różnią się drugim. Czy mogę odzyskać strukturę z klucza? Tylko przez wyszukanie w bazie danych, za pomocą konwertera InChIKey na SMILES.
Ostatnia aktualizacja: