SMILES-naar-InChI-converter
Kort gezegd: Zet SMILES-strings om in standaard-InChI-identificaties voor databanken en publicaties. Gratis, werkt in je webbrowser en zonder download.
Zet SMILES om in standaard-InChI om te zoeken, te indexeren en te publiceren.
Invoer- en uitvoerformaten
| Invoer: SMILES | Uitvoer: InChI | |
|---|---|---|
| Volledige naam | SMILES (Simplified Molecular Input Line Entry System) | InChI (IUPAC International Chemical Identifier) |
| Wat het bevat | Atomen, bindingen, ringen, ladingen en stereo als één regel tekst. Geen coördinaten. | Een gelaagde tekstidentificatie die uit de structuur wordt opgebouwd. De standaard-InChI is in elk programma gelijk. |
| Bestand of vorm | .smi of platte tekst | Tekst die begint met InChI=1S/ |
Bestandsformaat uitgelegd
SMILES is een compacte lijnnotatie voor de bindingsvolgorde van een molecuul. Het is handig voor tekentools, zoekvakken en scripts.
InChI is de IUPAC International Chemical Identifier. Het is een gelaagde, gestandaardiseerde identificatie, ontworpen voor uitwisseling, indexering en vergelijking in chemische databanken.
Gebruik SMILES als je een bewerkbare structuurstring nodig hebt. Gebruik InChI als je een gestandaardiseerde identificatie nodig hebt die minder afhangt van een bepaalde manier van SMILES-canonicalisatie.
Voorbeeld en de uitvoer lezen
De SMILES van aspirine, CC(=O)OC1=CC=CC=C1C(=O)O, wordt omgezet in:
InChI=1S/C9H8O4/c1-6(10)13-8-5-3-2-4-7(8)9(11)12/h2-5H,1H3,(H,11,12)
1S: versie 1, standaard-InChI.C9H8O4: de laag met de molecuulformule./c…: de connectiviteitslaag, met de eigen atoomnummering van InChI./h…: waar de waterstofatomen zitten; de haakjes markeren een beweeglijk waterstofatoom dat de twee zuurstofatomen van het carbonzuur delen.
Waarom hetzelfde molecuul altijd dezelfde InChI geeft
Aspirine kan door verschillende SMILES worden beschreven, afhankelijk van het atoom waarmee je begint. Standaard-InChI is canoniek, dus ze leveren allemaal precies de string hierboven op. Daardoor is InChI een goede keuze om structuren te vergelijken en dubbele te controleren.
FAQ
Is stereochemie inbegrepen? Ja. @ en @@ in SMILES worden de lagen /t, /m en /s in de InChI. Iets korters nodig? Gebruik SMILES naar InChIKey.
Laatst bijgewerkt: