محوّل SMILES إلى InChI
باختصار: حوّل سلاسل SMILES إلى معرّفات InChI القياسية لاستخدامها في قواعد البيانات والنشر العلمي. الأداة مجانية وتعمل في متصفح الويب دون الحاجة إلى تنزيل.
حوّل SMILES إلى InChI القياسي للبحث والفهرسة والنشر.
صيغ الإدخال والإخراج
| الإدخال: SMILES | الإخراج: InChI | |
|---|---|---|
| الاسم الكامل | SMILES (Simplified Molecular Input Line Entry System) | InChI (المعرّف الكيميائي الدولي من IUPAC) |
| ما الذي تحتويه | الذرات والروابط والحلقات والشحنات والكيمياء الفراغية في سطر نصي واحد. دون إحداثيات. | معرّف نصي متعدد الطبقات مبني من البنية. ويكون InChI القياسي هو نفسه في كل البرامج. |
| الملف أو الشكل | ملف .smi أو نص عادي | نص يبدأ بـ InChI=1S/ |
شرح صيغة الملف
SMILES ترميز خطي مختصر لترابط الذرات في الجزيء. وهو مناسب لأدوات الرسم وصناديق البحث والبرامج النصية.
InChI هو المعرّف الكيميائي الدولي من IUPAC. وهو معرّف قياسي متعدد الطبقات صُمّم لتبادل البيانات بين قواعد البيانات الكيميائية وفهرستها والمقارنة بينها.
استخدم SMILES عندما تحتاج إلى سلسلة بنية قابلة للتحرير. واستخدم InChI عندما تحتاج إلى معرّف قياسي لا يعتمد كثيرًا على أسلوب معيّن في توحيد SMILES (canonicalization).
مثال وقراءة الناتج
يتحوّل SMILES الأسبرين CC(=O)OC1=CC=CC=C1C(=O)O إلى:
InChI=1S/C9H8O4/c1-6(10)13-8-5-3-2-4-7(8)9(11)12/h2-5H,1H3,(H,11,12)
1S: الإصدار 1، InChI قياسي.C9H8O4: طبقة الصيغة الجزيئية./c…: طبقة الترابط، بترقيم الذرات الخاص بـ InChI./h…: مواضع ذرات الهيدروجين؛ وتشير الأقواس إلى هيدروجين متنقّل مشترك بين ذرتي أكسجين مجموعة الكربوكسيل.
لماذا يعطي الجزيء نفسه دائمًا InChI نفسه
يمكن لعدة سلاسل SMILES مختلفة أن تصف الأسبرين، بحسب الذرة التي تبدأ منها. أما InChI القياسي فهو موحَّد (canonical)، لذا تنتج كلها السلسلة المطابقة أعلاه. وهذا يجعل InChI خيارًا جيدًا لمقارنة البنى والتحقق من التكرارات.
الأسئلة الشائعة
هل تُضمَّن الكيمياء الفراغية؟ نعم. يتحوّل @ و@@ في SMILES إلى طبقات /t و/m و/s في InChI. هل تحتاج إلى شيء أقصر؟ استخدم SMILES إلى InChIKey.
آخر تحديث: