เครื่องมือแปลง SMILES เป็น InChI
สรุปสั้น ๆ: แปลงสตริง SMILES เป็นตัวระบุ InChI มาตรฐานสำหรับฐานข้อมูลและการตีพิมพ์ ใช้งานฟรี ทำงานในเว็บเบราว์เซอร์ และไม่ต้องดาวน์โหลด
แปลง SMILES เป็น InChI มาตรฐานสำหรับการค้นหา การทำดัชนี และการตีพิมพ์
รูปแบบอินพุตและเอาต์พุต
| อินพุต: SMILES | เอาต์พุต: InChI | |
|---|---|---|
| ชื่อเต็ม | SMILES (Simplified Molecular Input Line Entry System) | InChI (IUPAC International Chemical Identifier) |
| ข้อมูลที่เก็บ | อะตอม พันธะ วง ประจุ และสเตอริโอเคมีในข้อความบรรทัดเดียว ไม่มีพิกัด | ตัวระบุแบบข้อความเป็นชั้น ๆ ที่สร้างจากโครงสร้าง InChI มาตรฐานเหมือนกันในทุกโปรแกรม |
| ไฟล์หรือรูปแบบ | .smi หรือข้อความธรรมดา | ข้อความที่ขึ้นต้นด้วย InChI=1S/ |
อธิบายรูปแบบไฟล์
SMILES เป็นสัญกรณ์บรรทัดเดียวที่กะทัดรัดสำหรับการเชื่อมต่อของโมเลกุล สะดวกสำหรับเครื่องมือวาด ช่องค้นหา และสคริปต์
InChI คือ International Chemical Identifier ของ IUPAC เป็นตัวระบุมาตรฐานแบบหลายชั้น ออกแบบมาเพื่อแลกเปลี่ยนข้อมูล ทำดัชนี และเปรียบเทียบในฐานข้อมูลเคมี
ใช้ SMILES เมื่อต้องการสตริงโครงสร้างที่แก้ไขได้ ใช้ InChI เมื่อต้องการตัวระบุมาตรฐานที่ไม่ขึ้นกับรูปแบบแคนอนิคัลของ SMILES แบบใดแบบหนึ่ง
ตัวอย่างและการอ่านผลลัพธ์
SMILES ของแอสไพริน CC(=O)OC1=CC=CC=C1C(=O)O แปลงได้เป็น:
InChI=1S/C9H8O4/c1-6(10)13-8-5-3-2-4-7(8)9(11)12/h2-5H,1H3,(H,11,12)
1S: เวอร์ชัน 1, InChI มาตรฐานC9H8O4: ชั้นสูตรโมเลกุล/c…: ชั้นการเชื่อมต่อ ใช้การนับหมายเลขอะตอมของ InChI เอง/h…: ตำแหน่งของไฮโดรเจน วงเล็บแสดงไฮโดรเจนเคลื่อนที่ที่ใช้ร่วมกันระหว่างออกซิเจนสองอะตอมของกรดคาร์บอกซิลิก
ทำไมโมเลกุลเดียวกันจึงให้ InChI เดียวกันเสมอ
SMILES หลายแบบอธิบายแอสไพรินได้ ขึ้นกับว่าเริ่มจากอะตอมใด InChI มาตรฐานเป็นแบบแคนอนิคัล ทุกแบบจึงให้สตริงเดียวกันข้างต้น InChI จึงเหมาะสำหรับเปรียบเทียบโครงสร้างและตรวจข้อมูลซ้ำ
คำถามพบบ่อย
รวมสเตอริโอเคมีหรือไม่? รวม @ และ @@ ใน SMILES จะกลายเป็นชั้น /t, /m และ /s ใน InChI ต้องการแบบที่สั้นกว่าหรือเปล่า? ใช้ SMILES เป็น InChIKey
อัปเดตล่าสุด: