Konwerter InChI na SMILES
W skrócie: konwertuj identyfikatory InChI na kanoniczne ciągi SMILES. Narzędzie jest darmowe, działa w przeglądarce i nie wymaga instalacji.
Konwertuj ciągi InChI z literatury i baz danych do formatu SMILES.
Formaty wejściowe i wyjściowe
| Dane wejściowe: InChI | Wynik: SMILES | |
|---|---|---|
| Pełna nazwa | InChI (IUPAC International Chemical Identifier) | SMILES (Simplified Molecular Input Line Entry System) |
| Co zawiera | Warstwowy identyfikator tekstowy tworzony na podstawie struktury. Standardowy InChI jest taki sam w każdym programie. | Atomy, wiązania, pierścienie, ładunki i stereochemia w jednej linii tekstu. Bez współrzędnych. |
| Plik lub forma | Tekst zaczynający się od InChI=1S/ | .smi lub zwykły tekst |
Formaty plików w skrócie
InChI to IUPAC International Chemical Identifier. Jest warstwowy, deterministyczny i przydatny do opisu wzoru sumarycznego, połączeń, wodorów, ładunku, stereochemii i izotopów.
SMILES jest krótszy i łatwiej wkleić go do wielu programów do rysowania, wyszukiwania i chemoinformatyki. Konwersja InChI na SMILES przydaje się, gdy baza danych podaje InChI, a twoja procedura oczekuje SMILES.
Różne usługi mogą zwracać różne kanoniczne SMILES dla tego samego InChI. Uznawaj równoważne ciągi SMILES za poprawne, jeśli opisują tę samą cząsteczkę.
Kiedy konwertować InChI na SMILES
InChI świetnie nadaje się do jednoznacznej identyfikacji związku, ale większość programów do rysowania, skryptów chemoinformatycznych i pól wyszukiwania oczekuje SMILES. Konwersja pozwala wziąć identyfikator z rekordu bazy danych lub materiałów uzupełniających artykułu i zamienić go na coś, co można edytować i rysować.
Jak z niego korzystać
- Wklej pełny ciąg InChI, łącznie z prefiksem
InChI=1S/. - Przekonwertuj, a potem skopiuj wynik SMILES.
- Wklej SMILES do MolDraw, aby zobaczyć i edytować strukturę.
Przykład
Etanol: InChI=1S/C2H6O/c1-2-3/h3H,2H2,1H3 staje się CCO. InChI podaje wzór, warstwę połączeń (atomy 1–2–3) i położenie wodorów; SMILES wyraża tę samą cząsteczkę trzema znakami.
FAQ
Czy stereochemia zostanie zachowana? Jeśli InChI zawiera warstwy stereo (/t, /m, /s lub /b), są one tłumaczone na symbole SMILES @ lub / i \. Dlaczego mój SMILES różni się od wyniku innego narzędzia? Jedna cząsteczka może mieć kilka poprawnych SMILES; porównaj je, konwertując oba na InChIKey narzędziem SMILES na InChIKey.
Ostatnia aktualizacja: