Konwerter nazw IUPAC na SMILES
W skrócie: Zamieniaj nazwy systematyczne na SMILES lub importuj związki z PubChem po nazwie/CID. Narzędzie jest darmowe, działa w przeglądarce i nie wymaga instalacji. Nazwy wpisuj po angielsku.
Zamieniaj angielskie nazwy IUPAC lub nazwy związków z PubChem na SMILES. Przydaje się do zamiany nazw z literatury na ciągi opisujące strukturę.
Formaty wejściowe i wyjściowe
| Dane wejściowe: nazwa IUPAC | Wynik: SMILES | |
|---|---|---|
| Pełna nazwa | Nazwa IUPAC | SMILES (Simplified Molecular Input Line Entry System) |
| Co zawiera | Systematyczną nazwę chemiczną utworzoną według reguł nazewnictwa IUPAC. | Atomy, wiązania, pierścienie, ładunki i stereochemię w jednym wierszu tekstu. Bez współrzędnych. |
| Plik lub postać | Tekst | .smi lub zwykły tekst |
Formaty plików w skrócie
Nazwy IUPAC to formalne nazwy chemiczne, które systematycznie opisują strukturę. Przydają się w publikacjach i nauczaniu, ale długie nazwy trudno wkleić do programów.
SMILES to zwarty ciąg opisujący strukturę, używany przez programy do rysowania, bazy danych, skrypty chemoinformatyczne i konwertery. Zamiana IUPAC na SMILES pomaga przekształcić nazwę z literatury w strukturę czytelną dla komputera.
Rozpoznawanie nazw działa najlepiej dla jednoznacznych, znanych nazw. Sole, mieszaniny, stereochemia, nazwy zwyczajowe i warianty pisowni mogą nie dać wyniku albo dać inny rekord.
Wskazówki dotyczące zamiany nazwy na SMILES
Systematyczne nazwy IUPAC precyzyjnie opisują strukturę, ale są długie i łatwo o literówkę. Zamiana nazwy na SMILES daje zwarty, czytelny dla komputera zapis struktury, który możesz wkleić do programów do rysowania lub arkuszy kalkulacyjnych.
Przykłady
- propan-2-ol →
CC(C)O - 2-acetyloxybenzoic acid (aspiryna) →
CC(=O)OC1=CC=CC=C1C(=O)O - (2S)-2-aminopropanoic acid (L-alanina) →
C[C@@H](C(=O)O)N
Jak uzyskać dobre wyniki
- Kopiuj nazwy dokładnie, z lokantami, przecinkami, łącznikami i nawiasami: 1,2-dichloroethane to nie to samo co 1,1-dichloroethane.
- Dodaj deskryptory stereochemiczne, np. (R), (S), (E) lub (Z), jeśli potrzebujesz konkretnego izomeru; w przeciwnym razie stereochemia może pozostać nieokreślona.
- Nazwy zwyczajowe, np. caffeine, często też działają, ale bardzo nowe lub rzadkie nazwy handlowe mogą nie działać.
- Uważaj na znaki typograficzne z plików PDF, np. specjalne myślniki lub primy, i zastępuj je zwykłymi łącznikami i apostrofami.
Potrzebujesz odwrotnej zamiany? Użyj narzędzia SMILES na nazwę IUPAC.
Ostatnia aktualizacja: