Convertidor de MOL a InChI
En resumen: convierte bloques de estructura MOL o SDF en identificadores InChI estándar para flujos de datos químicos. Es gratuito, funciona en tu navegador y no requiere descargas.
Pega un bloque MOL o SDF y conviértelo en un identificador InChI estándar.
Formatos de entrada y salida
| Entrada: archivo MOL | Salida: InChI | |
|---|---|---|
| Nombre completo | Archivo MOL (MDL Molfile) | InChI (identificador químico internacional de la IUPAC) |
| Qué contiene | Una lista de átomos con coordenadas 2D o 3D y una tabla de enlaces para una molécula. | Un identificador de texto por capas generado a partir de la estructura. El InChI estándar es el mismo en todos los programas. |
| Archivo o forma | .mol | Texto que empieza por InChI=1S/ |
Formatos de archivo
MOL almacena una molécula como tablas de átomos y enlaces, a menudo con coordenadas 2D o 3D. Es útil para intercambiar estructuras editables.
InChI es un identificador de texto normalizado generado a partir de la estructura. Es útil para buscar, indexar, registrar y comparar registros químicos entre bases de datos.
La calidad de la conversión depende de que el archivo MOL tenga átomos, enlaces, cargas y estereoquímica bien definidos. Revisa el InChI generado en cuanto a sales, tautómeros y capas estereoquímicas.
Acerca de los archivos MOL
Un archivo MOL (MDL Molfile) almacena una sola estructura como tabla de conexiones: una cabecera, una línea de recuentos, un bloque de átomos con coordenadas x, y, z y símbolos de elementos, y un bloque de enlaces que indica qué átomos están unidos y con qué orden de enlace. La mayoría de los programas de química pueden exportar MOL, lo que lo convierte en un formato de intercambio habitual. Existen dos versiones: V2000, el formato clásico de columnas fijas, y V3000, que admite moléculas más grandes y más funciones.
Por qué convertir a InChI
InChI proporciona un identificador estándar que no depende del orden de los átomos ni de las coordenadas del dibujo. Dos archivos MOL de la misma molécula dibujados de forma distinta producen el mismo InChI estándar, lo que facilita detectar duplicados o buscar en bases de datos.
Cómo usarlo
- Abre el archivo .mol en un editor de texto y cópialo todo, incluidas las líneas de cabecera y la línea final
M END. - Pégalo en el cuadro de entrada y conviértelo.
- Copia el InChI o acórtalo aún más con InChI a InChIKey.
Solución de problemas: los archivos MOL dependen de las columnas, así que un archivo reformateado por un procesador de textos puede fallar. Cópialo desde un editor de texto plano.
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