Konverter MOL ke InChI
Singkatnya: Ubah blok struktur MOL atau SDF menjadi pengenal InChI standar untuk alur kerja data kimia. Gratis, berjalan di peramban web Anda, dan tidak perlu diunduh.
Tempel blok MOL atau SDF dan ubah menjadi pengenal InChI standar.
Format masukan dan keluaran
| Masukan: file MOL | Keluaran: InChI | |
|---|---|---|
| Nama lengkap | File MOL (MDL Molfile) | InChI (IUPAC International Chemical Identifier) |
| Isi data | Daftar atom dengan koordinat 2D atau 3D dan tabel ikatan untuk satu molekul. | Pengenal teks berlapis yang dibangun dari struktur. InChI standar sama di setiap program. |
| File atau bentuk | .mol | Teks yang diawali InChI=1S/ |
Penjelasan Format File
MOL menyimpan molekul sebagai tabel atom dan ikatan, sering dengan koordinat 2D atau 3D. Format ini berguna untuk pertukaran struktur yang dapat disunting.
InChI adalah pengenal teks terstandar yang dihasilkan dari struktur. Pengenal ini berguna untuk pencarian, pengindeksan, registrasi, dan membandingkan rekaman kimia antar basis data.
Kualitas konversi bergantung pada file MOL yang memiliki atom, ikatan, muatan, dan stereokimia yang jelas. Periksa InChI yang dihasilkan untuk garam, tautomer, dan lapisan stereokimia.
Tentang file MOL
File MOL (MDL Molfile) menyimpan satu struktur sebagai tabel koneksi: header, baris hitungan (counts line), blok atom dengan koordinat x, y, z dan lambang unsur, serta blok ikatan yang mencantumkan atom mana yang terhubung dan dengan orde ikatan berapa. Sebagian besar perangkat lunak kimia dapat mengekspor MOL, sehingga format ini umum untuk pertukaran data. Ada dua versi: V2000, format kolom tetap klasik, dan V3000, yang mendukung molekul lebih besar dan lebih banyak fitur.
Mengapa mengubah ke InChI
InChI memberikan pengenal standar yang tidak bergantung pada urutan atom atau koordinat gambar. Dua file MOL dari molekul yang sama yang digambar berbeda menghasilkan InChI standar yang sama, sehingga mudah memeriksa duplikat atau mencari di basis data.
Cara menggunakannya
- Buka file .mol di editor teks dan salin seluruh isinya, termasuk baris header dan baris terakhir
M END. - Tempel ke kotak masukan lalu lakukan konversi.
- Salin InChI, atau persingkat lagi dengan InChI ke InChIKey.
Pemecahan masalah: file MOL peka terhadap posisi kolom, sehingga file yang diformat ulang oleh pengolah kata bisa gagal. Salin dari editor teks biasa.
Terakhir diperbarui: