MOL’dan InChI’ye Dönüştürücü

Kısaca: Kimyasal veri iş akışları için MOL veya SDF yapı bloklarını standart InChI tanımlayıcılarına dönüştürün. Ücretsizdir, web tarayıcınızda çalışır ve indirme gerektirmez.

Bir MOL veya SDF bloğu yapıştırın ve standart bir InChI tanımlayıcısına dönüştürün.

Dosya Biçimi Açıklaması

MOL, bir molekülü genellikle 2B veya 3B koordinatlarla birlikte atom ve bağ tabloları olarak saklar. Düzenlenebilir yapı alışverişi için kullanışlıdır.

InChI, yapıdan üretilen standartlaştırılmış bir metin tanımlayıcısıdır. Arama, dizinleme, kayıt ve kimyasal kayıtları veritabanları arasında karşılaştırmak için kullanışlıdır.

Dönüştürme kalitesi, MOL dosyasındaki atomların, bağların, yüklerin ve stereokimyanın net olmasına bağlıdır. Üretilen InChI’yi tuzlar, tautomerler ve stereokimyasal katmanlar açısından gözden geçirin.

MOL dosyaları hakkında

Bir MOL dosyası (MDL Molfile), tek bir yapıyı bağlantı tablosu olarak saklar: bir başlık, bir sayım satırı, x, y, z koordinatları ve element sembolleri içeren bir atom bloğu ve hangi atomların hangi bağ derecesiyle bağlı olduğunu listeleyen bir bağ bloğu. Çoğu kimya yazılımı MOL dışa aktarabildiği için yaygın bir alışveriş biçimidir. İki sürümü vardır: klasik sabit sütunlu biçim V2000 ve daha büyük molekülleri ve daha fazla özelliği destekleyen V3000.

Neden InChI’ye dönüştürmeli?

InChI, atom sırasına veya çizim koordinatlarına bağlı olmayan standart bir tanımlayıcı verir. Aynı molekülün farklı çizilmiş iki MOL dosyası aynı standart InChI’yi üretir; bu da yinelenenleri kontrol etmeyi veya veritabanlarında arama yapmayı kolaylaştırır.

Nasıl kullanılır

1. .mol dosyasını bir metin editöründe açın ve başlık satırları ile son M END satırı dahil her şeyi kopyalayın.
2. Girdi kutusuna yapıştırın ve dönüştürün.
3. InChI’yi kopyalayın veya InChI’den InChIKey’e ile daha da kısaltın.

Sorun giderme: MOL dosyaları sütun duyarlıdır; bu nedenle bir kelime işlemciyle yeniden biçimlendirilmiş dosya başarısız olabilir. Düz metin editöründen kopyalayın.