Conversor de MOL em InChI

Em resumo: converta blocos de estrutura MOL ou SDF em identificadores InChI padrão para fluxos de dados químicos. É gratuito, funciona no navegador e não precisa de download.

Cole um bloco MOL ou SDF e converta-o em um identificador InChI padrão.

Formatos de arquivo explicados

O MOL armazena uma molécula como tabelas de átomos e ligações, muitas vezes com coordenadas 2D ou 3D. É útil para trocar estruturas editáveis.

O InChI é um identificador de texto padronizado gerado a partir da estrutura. É útil para busca, indexação, registro e comparação de registros químicos entre bancos de dados.

A qualidade da conversão depende de o arquivo MOL ter átomos, ligações, cargas e estereoquímica claros. Revise o InChI gerado quanto a sais, tautômeros e camadas estereoquímicas.

Sobre arquivos MOL

Um arquivo MOL (MDL Molfile) armazena uma única estrutura como tabela de conexões: um cabeçalho, uma linha de contagens, um bloco de átomos com coordenadas x, y, z e símbolos dos elementos e um bloco de ligações que lista quais átomos estão conectados e com que ordem de ligação. A maioria dos programas de química exporta MOL, o que o torna um formato de troca comum. Existem duas versões: V2000, o formato clássico de colunas fixas, e V3000, que suporta moléculas maiores e mais recursos.

Por que converter para InChI

O InChI fornece um identificador padrão que não depende da ordem dos átomos nem das coordenadas do desenho. Dois arquivos MOL da mesma molécula desenhada de formas diferentes geram o mesmo InChI padrão, o que facilita verificar duplicatas ou pesquisar em bancos de dados.

Como usar

1. Abra o arquivo .mol em um editor de texto e copie tudo, incluindo as linhas de cabeçalho e a linha final M END.
2. Cole-o na caixa de entrada e converta.
3. Copie o InChI ou encurte-o ainda mais com InChI para InChIKey.

Solução de problemas: arquivos MOL dependem da posição das colunas, então um arquivo reformatado por um processador de texto pode falhar. Copie de um editor de texto simples.