محوّل MOL إلى InChI

باختصار: حوّل كتل البنى بصيغة MOL أو SDF إلى معرّفات InChI القياسية لسير عمل البيانات الكيميائية. الأداة مجانية وتعمل في متصفح الويب ولا تحتاج إلى تنزيل.

الصق كتلة MOL أو SDF وحوّلها إلى معرّف InChI قياسي.

شرح صيغة الملف

MOL يخزّن الجزيء في جداول ذرات وروابط، غالبًا مع إحداثيات ثنائية أو ثلاثية الأبعاد. وهو مفيد لتبادل بنى قابلة للتعديل.

InChI معرّف نصي قياسي يُولَّد من البنية. وهو مفيد للبحث والفهرسة والتسجيل ومقارنة السجلات الكيميائية بين قواعد البيانات.

تعتمد جودة التحويل على وضوح الذرات والروابط والشحنات والكيمياء الفراغية في ملف MOL. راجع InChI المولَّد من حيث الأملاح والمتصاوغات التوتومرية وطبقات الكيمياء الفراغية.

عن ملفات MOL

يخزّن ملف MOL ‏(MDL Molfile) بنية واحدة في جدول ترابط: ترويسة، وسطر أعداد، وكتلة ذرات بإحداثيات x وy وz ورموز العناصر، وكتلة روابط تبيّن الذرات المترابطة ورتبة كل رابطة. ويمكن لمعظم البرامج الكيميائية تصدير MOL، مما يجعله صيغة تبادل شائعة. وله إصداران: V2000 بالأعمدة الثابتة الكلاسيكية، وV3000 الذي يدعم جزيئات أكبر وميزات أكثر.

لماذا التحويل إلى InChI

يعطي InChI معرّفًا قياسيًا لا يعتمد على ترتيب الذرات أو إحداثيات الرسم. فملفا MOL للجزيء نفسه المرسوم بطريقتين مختلفتين يعطيان InChI القياسي نفسه، مما يسهّل كشف المكررات أو البحث في قواعد البيانات.

طريقة الاستخدام

1. افتح ملف ‎.mol في محرر نصوص وانسخ كل محتواه، بما فيه أسطر الترويسة والسطر الأخير M END.
2. الصقه في مربع الإدخال وحوّله.
3. انسخ InChI، أو اختصره أكثر بأداة InChI إلى InChIKey.

حل المشكلات: ملفات MOL حساسة لمواضع الأعمدة، لذا قد يفشل ملف أعاد معالج النصوص تنسيقه. انسخ من محرر نصوص عادي.