Convertitore da MOL a InChI
In breve: converti blocchi di struttura MOL o SDF in identificatori InChI standard per flussi di lavoro con dati chimici. È gratuito, funziona nel browser web e non richiede download.
Incolla un blocco MOL o SDF e convertilo in un identificatore InChI standard.
Formati di input e output
| Input: file MOL | Output: InChI | |
|---|---|---|
| Nome completo | File MOL (MDL Molfile) | InChI (IUPAC International Chemical Identifier) |
| Cosa contiene | Un elenco di atomi con coordinate 2D o 3D e una tabella dei legami per una molecola. | Un identificatore testuale a livelli costruito dalla struttura. L'InChI standard è lo stesso in ogni programma. |
| File o forma | .mol | Testo che inizia con InChI=1S/ |
Formati di file spiegati
Il formato MOL memorizza una molecola come tabelle di atomi e legami, spesso con coordinate 2D o 3D. È utile per scambiare strutture modificabili.
L'InChI è un identificatore testuale standardizzato generato dalla struttura. È utile per ricerca, indicizzazione, registrazione e confronto di record chimici tra database.
La qualità della conversione dipende da un file MOL con atomi, legami, cariche e stereochimica chiari. Controlla l'InChI generato per sali, tautomeri e livelli stereochimici.
Informazioni sui file MOL
Un file MOL (MDL Molfile) memorizza una singola struttura come tabella delle connessioni: un'intestazione, una riga dei conteggi, un blocco degli atomi con coordinate x, y, z e simboli degli elementi e un blocco dei legami che elenca quali atomi sono connessi e con quale ordine di legame. La maggior parte dei software di chimica può esportare in MOL, il che lo rende un formato di scambio comune. Esistono due versioni: V2000, il classico formato a colonne fisse, e V3000, che supporta molecole più grandi e più funzionalità.
Perché convertire in InChI
L'InChI fornisce un identificatore standard che non dipende dall'ordine degli atomi né dalle coordinate del disegno. Due file MOL della stessa molecola disegnata in modo diverso producono lo stesso InChI standard, il che rende facile cercare duplicati o fare ricerche nei database.
Come si usa
- Apri il file .mol in un editor di testo e copia tutto, comprese le righe di intestazione e la riga finale
M END. - Incollalo nella casella di input e converti.
- Copia l'InChI, oppure accorcialo ulteriormente con da InChI a InChIKey.
Risoluzione dei problemi: i file MOL dipendono dalle colonne, quindi un file riformattato da un programma di videoscrittura può non funzionare. Copia da un editor di testo semplice.
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