เครื่องมือแปลง MOL เป็น InChI
สรุปสั้น ๆ: แปลงบล็อกโครงสร้าง MOL หรือ SDF เป็นตัวระบุ InChI มาตรฐานสำหรับงานข้อมูลเคมี ใช้งานฟรี ทำงานในเว็บเบราว์เซอร์ และไม่ต้องดาวน์โหลด
วางบล็อก MOL หรือ SDF แล้วแปลงเป็นตัวระบุ InChI มาตรฐาน
รูปแบบอินพุตและเอาต์พุต
| อินพุต: ไฟล์ MOL | เอาต์พุต: InChI | |
|---|---|---|
| ชื่อเต็ม | ไฟล์ MOL (MDL Molfile) | InChI (IUPAC International Chemical Identifier) |
| ข้อมูลที่เก็บ | รายการอะตอมพร้อมพิกัด 2 มิติหรือ 3 มิติ และตารางพันธะของโมเลกุลหนึ่งโมเลกุล | ตัวระบุแบบข้อความเป็นชั้น ๆ ที่สร้างจากโครงสร้าง InChI มาตรฐานเหมือนกันในทุกโปรแกรม |
| ไฟล์หรือรูปแบบ | .mol | ข้อความที่ขึ้นต้นด้วย InChI=1S/ |
อธิบายรูปแบบไฟล์
MOL เก็บโมเลกุลเป็นตารางอะตอมและพันธะ มักมีพิกัด 2 มิติหรือ 3 มิติ มีประโยชน์สำหรับแลกเปลี่ยนโครงสร้างที่แก้ไขได้
InChI เป็นตัวระบุแบบข้อความมาตรฐานที่สร้างจากโครงสร้าง มีประโยชน์สำหรับการค้นหา การทำดัชนี การลงทะเบียน และการเปรียบเทียบระเบียนสารเคมีระหว่างฐานข้อมูล
คุณภาพการแปลงขึ้นกับว่าไฟล์ MOL ระบุอะตอม พันธะ ประจุ และสเตอริโอเคมีไว้ชัดเจนหรือไม่ ตรวจสอบ InChI ที่ได้ในส่วนของเกลือ เทาโทเมอร์ และชั้นสเตอริโอเคมี
เกี่ยวกับไฟล์ MOL
ไฟล์ MOL (MDL Molfile) เก็บโครงสร้างเดียวในรูปตารางการเชื่อมต่อ ได้แก่ หัวเรื่อง บรรทัดจำนวน บล็อกอะตอมที่มีพิกัด x, y, z และสัญลักษณ์ธาตุ และบล็อกพันธะที่ระบุว่าอะตอมใดเชื่อมกันด้วยอันดับพันธะเท่าใด โปรแกรมเคมีส่วนใหญ่ส่งออก MOL ได้ จึงเป็นรูปแบบแลกเปลี่ยนที่ใช้กันทั่วไป มีสองเวอร์ชัน: V2000 รูปแบบคอลัมน์คงที่แบบดั้งเดิม และ V3000 ซึ่งรองรับโมเลกุลขนาดใหญ่และฟีเจอร์มากขึ้น
ทำไมต้องแปลงเป็น InChI
InChI ให้ตัวระบุมาตรฐานที่ไม่ขึ้นกับลำดับอะตอมหรือพิกัดการวาด ไฟล์ MOL สองไฟล์ของโมเลกุลเดียวกันที่วาดต่างกันจะได้ InChI มาตรฐานเดียวกัน ทำให้ตรวจหารายการซ้ำหรือค้นหาในฐานข้อมูลได้ง่าย
วิธีใช้
- เปิดไฟล์ .mol ในโปรแกรมแก้ไขข้อความแล้วคัดลอกทั้งหมด รวมถึงบรรทัดหัวเรื่องและบรรทัด
M ENDสุดท้าย - วางลงในช่องอินพุตแล้วแปลง
- คัดลอก InChI หรือย่อให้สั้นลงอีกด้วยInChI เป็น InChIKey
การแก้ปัญหา: ไฟล์ MOL ขึ้นกับตำแหน่งคอลัมน์ ไฟล์ที่ถูกจัดรูปแบบใหม่ด้วยโปรแกรมประมวลผลคำอาจใช้ไม่ได้ ให้คัดลอกจากโปรแกรมแก้ไขข้อความธรรมดา
อัปเดตล่าสุด: