Convertisseur InChI en SMILES
En bref : convertissez des identifiants InChI en chaînes SMILES canoniques. C'est gratuit, cela fonctionne dans votre navigateur et ne nécessite aucun téléchargement.
Convertissez au format SMILES des chaînes InChI issues de la littérature et des bases de données.
Formats d'entrée et de sortie
| Entrée : InChI | Sortie : SMILES | |
|---|---|---|
| Nom complet | InChI (IUPAC International Chemical Identifier) | SMILES (Simplified Molecular Input Line Entry System) |
| Contenu | Un identifiant textuel en couches construit à partir de la structure. L'InChI standard est le même dans tous les logiciels. | Atomes, liaisons, cycles, charges et stéréochimie sur une seule ligne de texte. Pas de coordonnées. |
| Fichier ou forme | Texte commençant par InChI=1S/ | .smi ou texte brut |
Les formats de fichier expliqués
InChI est l'identifiant chimique international de l'IUPAC. Il est structuré en couches, déterministe, et décrit la formule brute, la connectivité, les hydrogènes, la charge, la stéréochimie et les isotopes.
SMILES est plus court et plus facile à coller dans de nombreux outils de dessin, de recherche et de chémoinformatique. Convertir un InChI en SMILES est utile quand une base de données fournit l'InChI alors que votre flux de travail attend un SMILES.
Différents services peuvent renvoyer des SMILES canoniques différents pour un même InChI. Des chaînes SMILES équivalentes sont valables si elles décrivent la même molécule.
Quand convertir un InChI en SMILES
L'InChI est excellent pour identifier un composé sans ambiguïté, mais la plupart des logiciels de dessin, des scripts de chémoinformatique et des champs de recherche attendent un SMILES. La conversion vous permet de prendre un identifiant issu d'une fiche de base de données ou des données supplémentaires d'un article et d'en faire une structure à modifier et à dessiner.
Mode d'emploi
- Collez une chaîne InChI complète, préfixe
InChI=1S/compris. - Lancez la conversion, puis copiez le SMILES obtenu.
- Collez le SMILES dans MolDraw pour voir et modifier la structure.
Exemple
Éthanol : InChI=1S/C2H6O/c1-2-3/h3H,2H2,1H3 devient CCO. L'InChI indique la formule brute, la couche de connectivité (atomes 1–2–3) et la position des hydrogènes ; le SMILES exprime la même molécule en trois caractères.
FAQ
La stéréochimie est-elle conservée ? Si l'InChI contient des couches stéréo (/t, /m, /s ou /b), elles sont traduites en symboles SMILES @ ou / et \. Pourquoi mon SMILES diffère-t-il de celui d'un autre outil ? Une molécule peut avoir plusieurs SMILES valides ; comparez-les en convertissant les deux en InChIKey avec SMILES en InChIKey.
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