Convertisseur nom IUPAC en SMILES
En bref : convertissez des noms systématiques en SMILES ou importez des composés depuis PubChem par nom ou CID. C'est gratuit, cela fonctionne dans votre navigateur et ne nécessite aucun téléchargement.
Convertissez des noms IUPAC ou des noms de composés PubChem en SMILES. Pratique pour transformer des noms tirés de la littérature en chaînes de structure.
Formats d'entrée et de sortie
| Entrée : nom IUPAC | Sortie : SMILES | |
|---|---|---|
| Nom complet | Nom IUPAC | SMILES (Simplified Molecular Input Line Entry System) |
| Contenu | Le nom chimique systématique établi selon les règles de nomenclature IUPAC. | Atomes, liaisons, cycles, charges et stéréochimie sur une seule ligne de texte. Pas de coordonnées. |
| Fichier ou forme | Texte | .smi ou texte brut |
Les formats de fichier expliqués
Les noms IUPAC sont des noms chimiques formels conçus pour décrire la structure de manière systématique. Ils sont utiles dans les publications et l'enseignement, mais les noms longs sont parfois difficiles à coller dans des logiciels.
SMILES est une chaîne de structure compacte utilisée par les outils de dessin, les bases de données, les scripts de chémoinformatique et les convertisseurs. Convertir un nom IUPAC en SMILES permet de transformer un nom de la littérature en structure lisible par une machine.
La résolution des noms fonctionne mieux avec des noms reconnus et sans ambiguïté. Les sels, les mélanges, la stéréochimie, les noms usuels et les variantes d'orthographe peuvent ne donner aucun résultat ou une autre fiche.
Conseils pour convertir un nom en SMILES
Les noms IUPAC systématiques décrivent une structure avec précision, mais ils sont longs et faciles à mal saisir. Convertir un nom en SMILES vous donne une structure compacte, lisible par une machine, à coller dans des outils de dessin ou des tableurs.
Exemples
- propan-2-ol →
CC(C)O - 2-acetyloxybenzoic acid (acide 2-acétyloxybenzoïque, aspirine) →
CC(=O)OC1=CC=CC=C1C(=O)O - (2S)-2-aminopropanoic acid (acide (2S)-2-aminopropanoïque, L-alanine) →
C[C@@H](C(=O)O)N
Obtenir de bons résultats
- Copiez les noms (en anglais) exactement, avec les indices de position, virgules, tirets et parenthèses : 1,2-dichloroethane n'est pas la même chose que 1,1-dichloroethane.
- Ajoutez les stéréodescripteurs comme (R), (S), (E) ou (Z) si vous voulez un isomère précis ; sinon la stéréochimie peut rester indéfinie.
- Les noms usuels comme caffeine fonctionnent souvent aussi, mais pas forcément les noms commerciaux très récents ou rares.
- Attention aux caractères typographiques copiés depuis des PDF, comme les tirets spéciaux ou les primes : remplacez-les par des tirets et apostrophes simples.
Dans l'autre sens ? Utilisez SMILES en nom IUPAC.
Dernière mise à jour :